Mononucleotide repeats represent an important source of polymorphic microsatellite markers in <i>Aspergillus nidulans</i>
Notice bibliographique
Résumé
In fungi, microsatellites occur less frequently throughout the genome and tend to be less polymorphic compared with other organisms. Most studies that develop microsatellites for fungi focus on dinucleotide and trinucleotide repeats, and thus mononucleotide repeats, which are much more abundant in fungal genomes, may represent an overlooked resource. This study examined the relative probabilities of polymorphism in mononucleotide, dinucleotide and trinucleotide repeats in Aspergillus nidulans. As previously found, the probability of polymorphism increased with increasing number of repeating units. Dinucleotide and trinucleotide repeats had higher probabilities of polymorphism than mononucleotide repeats, but this was offset by the presence of numerous long mononucleotide repeats within the genome. Mononucleotide microsatellites with 20 or more repeating units have a probability of polymorphism similar to dinucleotide and trinucleotide microsatellites, and therefore, consideration of mononucleotide repeats will substantially increase the number of potential markers available.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».