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Enregistrement W1599903166 · doi:10.1111/j.1750-3639.2010.00464.x

Loss of the Protein‐Tyrosine Phosphatase DEP‐1/PTPRJ Drives Meningioma Cell Motility

2010· article· en· W1599903166 sur OpenAlexaff
Astrid Petermann, Daniela Haase, Andrea Wetzel, Kamal K. Balavenkatraman, Tencho Tenev, Karl‐Heinz Gührs, Sabrina Friedrich, Makoto Nakamura, Christian Mawrin, Frank‐D. Böhmer

Notice bibliographique

RevueBrain Pathology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesUniversity of California, San Francisco
Mots-clésMotilityProtein tyrosine phosphataseCell biologyBiologyCancer researchCarcinogenesisCell growthPhenotypeTyrosine phosphorylationSignal transductionBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DEP-1/PTPRJ is a transmembrane protein-tyrosine phosphatase which has been proposed as a suppressor of epithelial tumors. We have found loss of heterozygosity (LOH) of the PTPRJ gene and loss of DEP-1 protein expression in a subset of human meningiomas. RNAi-mediated suppression of DEP-1 in DEP-1 positive meningioma cell lines caused enhanced motility and colony formation in semi-solid media. Cells devoid of DEP-1 exhibited enhanced signaling of endogenous platelet-derived growth factor (PDGF) receptors, and reduced paxillin phosphorylation upon seeding. Moreover, DEP-1 loss caused diminished adhesion to different matrices, and impaired cell spreading. DEP-1-deficient meningioma cells exhibited invasive growth in an orthotopic xenotransplantation model in nude mice, indicating that elevated motility translates into a biological phenotype in vivo. We propose that negative regulation of PDGF receptor signaling and positive regulation of adhesion signaling by DEP-1 cooperate in inhibition of meningioma cell motility, and possibly tumor invasiveness. These phenotypes of DEP-1 loss reveal functions of DEP-1 in adherent cells, and may be more generally relevant for tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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