Identification of Amelotin‐ and ODAM‐interacting enamel matrix proteins using the yeast two‐hybrid system
Notice bibliographique
Résumé
The formation of dental enamel is a prototype of functional tissue development through biomineralization. Amelotin (AMTN) is a recently discovered secreted enamel protein predominantly expressed during the maturation stage of enamel formation. It accumulates in a basal lamina-like structure at the interface between ameloblasts and enamel mineral and it co-localizes with another recently described enamel protein, odontogenic ameloblast-associated protein (ODAM). The purpose of this study was to determine whether AMTN and ODAM bind to each other and/or to other well-established enamel matrix proteins. The coding sequences of all enamel proteins were cloned into appropriate vectors of the GAL4-based Matchmaker Gold Yeast Two-Hybrid System. The growth of yeast cells on selective media and color induction were used as indicators for reporter gene expression through protein-protein interactions in combinations of prey and bait constructs. We found that AMTN interacts with itself and with ODAM, but not with amelogenin (AMEL), ameloblastin (AMBN), or enamelin (ENAM). Using ODAM as bait, the interaction with AMTN was confirmed. Furthermore, ODAM was found to bind to itself and to AMBN, as well as weakly to AMEL but not to ENAM. We propose a model where the distinct expression of AMTN and ODAM and their interaction are involved in defining the enamel microstructure at the enamel surface.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».