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Enregistrement W1602011839 · doi:10.4049/jimmunol.0802586

Intracellular Receptor for Human Host Defense Peptide LL-37 in Monocytes

2009· article· en· W1602011839 sur OpenAlexaff
Neeloffer Mookherjee, Dustin Lippert, Pamela Hamill, Reza Falsafi, Anastasia Nijnik, Jason Kindrachuk, Jelena Pistolic, Jennifer L. Gardy, Pegah Miri, Misbah Naseer, Leonard J. Foster, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInnate immune systemBiologyGene silencingCell biologyGlyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenaseChemokineImmune systemImmunologyGene expressionBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human cationic host defense peptide LL-37 has a broad range of immunomodulatory, anti-infective functions. A synthetic innate defense regulator peptide, innate defense regulator 1 (IDR-1), based conceptually on LL-37, was recently shown to selectively modulate innate immunity to protect against a wide range of bacterial infections. Using advanced proteomic techniques, ELISA, and Western blotting procedures, GAPDH was identified as a direct binding partner for LL-37 in monocytes. Enzyme kinetics and mobility shift studies also indicated LL-37 and IDR-1 binding to GAPDH. The functional relevance of GAPDH in peptide-induced responses was demonstrated by using gene silencing of GAPDH with small interfering RNA (siRNA). Previous studies have established that the induction of chemokines and the anti-inflammatory cytokine IL-10 are critical immunomodulatory functions in the anti-infective properties of LL-37 and IDR-1, and these functions are modulated by the MAPK p38 pathway. Consistent with that, this study demonstrated the importance of the GAPDH interactions with these peptides since gene silencing of GAPDH resulted in impaired p38 MAPK signaling, downstream chemokine and cytokine transcriptional responses induced by LL-37 and IDR-1, and LL-37-induced cytokine production. Bioinformatic analysis, using InnateDB, of the major interacting partners of GAPDH indicated the likelihood that this protein can impact on innate immune pathways including p38 MAPK. Thus, this study has demonstrated a novel function for GAPDH as a mononuclear cell receptor for human cathelicidin LL-37 and immunomodulatory IDR-1 and conclusively demonstrated its relevance in the functioning of cationic host defense peptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations160
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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