Comparative analysis of triplex nucleic acid test assays in United States blood donors
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: This study assessed the clinical sensitivity of three fully automated, human immunodeficiency virus (HIV), hepatitis C virus (HCV), and hepatitis B virus (HBV) triplex nucleic acid test (NAT) assays by individual donation (ID-NAT) and at operational minipool (MP-NAT) sizes used worldwide. STUDY DESIGN AND METHODS: MPX, Ultrio, and Ultrio Plus were used to test 2222 pedigreed, marker-positive samples with varying viral loads, each from a unique US blood donor. NAT-positive, seronegative yield samples (16 HBV, 156 HCV, and 23 HIV) were tested in replicates of three; undiluted; and in 1:6, 1:8, and 1:16 dilutions (MP6, MP8, and MP16), simulating various MP sizes. Seropositive samples (1276 HBV, 488 HCV, and 263 HIV) were tested by ID-NAT in singlet. RESULTS: MPX-MP6 and Ultrio Plus-MP16 had equivalent HCV sensitivity. Although Ultrio Plus-MP16 for HIV trended toward lesser sensitivity, this was not corroborated in a large substudy of low-viral-load samples in which Ultrio Plus-MP8/MP16 showed 100% reactivity. MPX-ID and Ultrio Plus-ID HBV clinical sensitivity were identical, but MPX-MP6 was significantly more sensitive than Ultrio Plus-MP16; the differential yield projected to one HBV NAT yield per 4.72 million US donations. Ultrio Plus HBV sensitivity did not increase at MP8 versus MP16. Ultrio Plus versus Ultrio sensitivity was significantly increased in HBV-infected donors with early acute, late acute or chronic, and occult infections. No difference in sensitivity was noted for any virus for MPX-MP6 versus Ultrio Plus-ID. CONCLUSIONS: Our data support US donation screening with MPX-MP6 or Ultrio Plus-MP16 since the HBV DNA detection of Ultrio Plus was significantly enhanced (vs. Ultrio) without compromising HIV or HCV RNA detection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».