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Enregistrement W1603693213 · doi:10.1074/jbc.m705286200

The PSF·p54nrb Complex Is a Novel Mnk Substrate That Binds the mRNA for Tumor Necrosis Factor α

2007· article· en· W1603693213 sur OpenAlexafffund
Maria Buxadé, Nick Morrice, Danielle L. Krebs, Christopher G. Proud

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionUniversity of Dundee
Mots-clésPhosphorylationRNA splicingKinaseBiologyCell biologyBinding siteMolecular biologyChemistryBiochemistryRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify new potential substrates for the MAP kinase signal-integrating kinases (Mnks), we employed a proteomic approach. The Mnks are targeted to the translational machinery through their interaction with the cap-binding initiation factor complex. We tested whether proteins retained on cap resin were substrates for the Mnks in vitro, and identified one such protein as PSF (the PTB (polypyrimidine tract-binding protein)-associated splicing factor). Mnks phosphorylate PSF at two sites in vitro, and our data show that PSF is an Mnk substrate in vivo. We also demonstrate that PSF, together with its partner, p54(nrb), binds RNAs that contain AU-rich elements (AREs), such as those for proinflammatory cytokines (e.g. tumor necrosis factor alpha (TNFalpha)). Indeed, PSF associates specifically with the TNFalpha mRNA in living cells. PSF is phosphorylated at two sites by the Mnks. Our data show that Mnk-mediated phosphorylation increases the binding of PSF to the TNFalpha mRNA in living cells. These findings identify a novel Mnk substrate. They also suggest that the Mnk-catalyzed phosphorylation of PSF may regulate the fate of specific mRNAs by modulating their binding to PSF.p54(nrb).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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