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Enregistrement W1605044531

GMACE variance estimation

2013· article· en· W1605044531 sur OpenAlexaff
P G Sullivan

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Dairy Commission
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStatisticsVariance (accounting)EstimationCovarianceMathematicsEconometricsMaceEconomics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estimation of genomic variances for GMACE is similar to the estimation of genetic variances for MACE, and is based on REML equations that include a prediction error variance term.  For GMACE, the prediction error variances must be approximated, and this approximation was improved in the present study to better reflect statistical covariance between the national GEBV of young bull and MACE EBV of parents.  In previous estimation, some parental information was being excluded, allowing a simple approximation to work well, but the simple approximation did not work well after including all parental information.  Use of any approximation can bias genomic variance estimates, and such bias would adversely affect conversions of genomic information from the evaluation scales of GEBV to non-GEBV countries.  This bias was minimized by scaling, to eliminate across-country average difference between estimated variance from GMACE relative to MACE.  This MACE-neutral scaling of genomic variance estimates does not affect bull comparisons among GEBV countries, because it does not alter relative genomic variances.  However, it should improve comparisons between GEBV and non-GEBV countries.  The new estimates of genomic variances were very similar to previous estimates from the same data.  Some individual estimates changed, but the rankings of countries from high to low variance were nearly identical as before.  As such, all GMACE bull rankings were nearly identical to previous rankings, with correlations higher than 0.997 for all 5 traits studied and all country scales.  Standard deviations of GMACE predicted breeding values were also very similar, within 1% of the previous in almost all cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,098

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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