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Enregistrement W1605189549 · doi:10.1111/j.1439-0329.2011.00752.x

Molecular cloning and gene transcription analyses of barwin‐type PR‐4 genes from <i>Phellinus sulphurascens</i>‐infected Douglas‐fir seedlings

2011· article· en· W1605189549 sur OpenAlexafffund
Rona N. Sturrock, A.K.M. Ekramoddoullah

Notice bibliographique

RevueForest Pathology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesMinistry of Forests, Lands and Natural Resource Operations
Mots-clésBiologyGeneComplementary DNAOpen reading frameCloning (programming)Molecular biologycDNA libraryPathogenMolecular cloningGeneticsTranscription (linguistics)Peptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary To better understand the molecular basis of interactions between the laminated root rot pathogen Phellinus sulphurascens Pilát and its principal host, Douglas‐fir [DF; Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco.], we constructed a cDNA library from roots of P. sulphurascens ‐infected DF seedlings. From a total of 3600 random cDNA clones, we identified 56 clones that matched with barley wound induced (barwin)‐type pathogenesis‐related 4 (PR4) genes that have been reported in planta. At least three PR4 genes comprising 426‐ to 444‐bp full‐length open reading frames, Pm PR4a1 , Pm PR4a2, and Pm PR4b1 , were identified from DF seedlings. Deduced amino acid sequences for the proteins encoded by these genes confirmed that two of them are acidic (Mr, 12.8–13.0 kDa; p I , 4.12–4.53) and one is a basic (Mr, 13.0 kDa; p I , 8.53) PR4 protein. Quantitative reverse transcriptase‐PCR analyses of these transcripts showed significantly higher transcription in P. sulphurascens ‐infected vs. control DF tissues. Upregulation of the transcripts in roots of a P. sulphurascens‐ resistant DF family was significant. Our results suggest that DF PR4 genes play an important role in the defence mechanism of DF against P. sulphurascens infection and thus could be useful in DF breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,170
Score d'incertitude au seuil0,907

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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