Molecular cloning and gene transcription analyses of barwin‐type PR‐4 genes from <i>Phellinus sulphurascens</i>‐infected Douglas‐fir seedlings
Notice bibliographique
Résumé
Summary To better understand the molecular basis of interactions between the laminated root rot pathogen Phellinus sulphurascens Pilát and its principal host, Douglas‐fir [DF; Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco.], we constructed a cDNA library from roots of P. sulphurascens ‐infected DF seedlings. From a total of 3600 random cDNA clones, we identified 56 clones that matched with barley wound induced (barwin)‐type pathogenesis‐related 4 (PR4) genes that have been reported in planta. At least three PR4 genes comprising 426‐ to 444‐bp full‐length open reading frames, Pm PR4a1 , Pm PR4a2, and Pm PR4b1 , were identified from DF seedlings. Deduced amino acid sequences for the proteins encoded by these genes confirmed that two of them are acidic (Mr, 12.8–13.0 kDa; p I , 4.12–4.53) and one is a basic (Mr, 13.0 kDa; p I , 8.53) PR4 protein. Quantitative reverse transcriptase‐PCR analyses of these transcripts showed significantly higher transcription in P. sulphurascens ‐infected vs. control DF tissues. Upregulation of the transcripts in roots of a P. sulphurascens‐ resistant DF family was significant. Our results suggest that DF PR4 genes play an important role in the defence mechanism of DF against P. sulphurascens infection and thus could be useful in DF breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».