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Enregistrement W1605272245 · doi:10.1186/1472-6947-5-8

Developing optimal search strategies for detecting clinically sound and relevant causation studies in EMBASE

2005· article· en· W1605272245 sur OpenAlexaff
R. Brian Haynes, Monika Kastner, Nancy L Wilczynski

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Informatics and Decision Making · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesU.S. National Library of Medicine
Mots-clésCausationHealth informaticsSound (geography)Computer scienceData scienceMedicinePublic healthPathologyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Evaluating the existence and strength of an association between a putative cause and adverse clinical outcome is complex and best done by assessing all available evidence. With the increasing burden of chronic disease, greater time demands on health professionals, and the explosion of information, effective retrieval of best evidence has become both more important and more difficult. Optimal search retrieval can be hampered by a number of obstacles, especially poor search strategies, but using empirically tested methodological search filters can enhance the accuracy of searches for sound evidence concerning etiology. Although such filters have previously been developed for studies of relevance to causation in MEDLINE, no empirically tested search strategy exists for EMBASE. METHODS: An analytic survey was conducted, comparing hand searches of journals with retrievals from EMBASE for candidate search terms and combinations. 6 research assistants read all issues of 55 journals indexed in EMBASE. All articles were rated using purpose and quality indicators and categorized into clinically relevant original studies, review articles, general papers, or case reports. The original and review articles were then categorized as 'pass' or 'fail' for scientific merit according to explicit criteria in the areas of causation (etiology) and other clinical topics. Candidate search strategies were developed for causation, then run in a subset of 55 EMBASE journals, the retrievals being compared with the hand search data. The sensitivity, specificity, precision, and accuracy of the search strategies were calculated. RESULTS: Of the 1489 studies classified as causation, 14% were methodologically sound. When search terms were combined, sensitivity reached 92%. Compared with the best single-term strategy, the best combination of terms resulted in an absolute increase in sensitivity (19%) and specificity (5.2%). Maximizing specificity for combined terms resulted in an increase of 7.1% compared with the single term but this came at an expense of sensitivity (39% absolute decrease). A search strategy that optimized the trade-off between sensitivity and specificity achieved 81.9% for sensitivity and 81.4% for specificity. CONCLUSION: We have discovered search strategies that retrieve high quality studies of causation from EMBASE with high sensitivity, high specificity, or an optimal balance of each.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,117
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,085
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,975
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1170,085
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,793
Tête enseignante GPT0,611
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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