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Enregistrement W1610235537 · doi:10.4049/jimmunol.180.2.1050

Distinct Structural Requirements of GATA-3 for the Regulation of Thymocyte and Th2 Cell Differentiation

2008· article· en· W1610235537 sur OpenAlexaff
Sung‐Yun Pai, Bok Yun Kang, Amelia M. Sabadini, Emilio Parisini, Morgan Truitt, I‐Cheng Ho

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthCharles H. Hood Foundation
Mots-clésGATA transcription factorGATA2Transcription factorGATA4BiologyCell biologyZinc fingerCellular differentiationCell fate determinationHeterologousFunction (biology)GeneticsPromoterGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GATA-3, the only T cell-specific member of the GATA family of transcription factors, is essential for the intrathymic development of CD4+ T cells and for the differentiation of Th2 cells. However, whether distinct biochemical features, unique to GATA-3 compared with other GATA family members, are required to drive T cell transcriptional programs or whether the T cell-specific functions of GATA-3 can simply be ascribed to its expression pattern is unclear. Nor do we understand the protein structural requirements for each individual function of GATA-3. In this study, we report that a heterologous GATA factor, GATA-4, was competent in supporting the development of CD4+ T cells but could not fully compensate for GATA-3 in regulating the expression of Th cytokines. Specifically, GATA-3 was more potent than GATA-4 in driving the production of IL-13 due to a mechanism independent of DNA binding or chromatin remodeling of the IL-13 locus. The difference was mapped to a partially conserved region C-terminal to the second zinc finger. Converting a single proline residue located in this region of GATA-4 to its counterpart, a methionine of GATA-3, was sufficient to enhance the IL-13-promoting function of GATA-4 but had no effect on other cytokines. Taken together, our data demonstrate that the unique function of GATA-3 is conferred by both its cell type-specific expression and distinct protein structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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