Evolution of sex and recombination in large, finite populations
Notice bibliographique
Résumé
This thesis investigates how breaking apart selection interference (‘Hill-Robertson’ effects) \nthat arises between linked loci can select for higher levels of recombination. \nSpecifically, it mainly studies how the presence of both advantageous and deleterious \nmutation affects selection for recombination. These evolutionary advantages are subsequently \ninvestigated with regards to sex resisting asexual invasion in a subdivided \npopulation. \ni) KEIGHTLEY and OTTO (2006) showed a strong advantage to recombination in \nbreaking apart selection interference, if it acts across multiple, linked loci subject to \nrecurrent deleterious mutation. Their model is modified to consider selection acting \non recombination if a small proportion of mutations are advantageous. This leads \nto a greater increase in selection acting on a recombination modifier, compared to \ncases where only deleterious mutations are present. \nii) Branching-process methods are developed to quantify how likely it is that a deleterious \nmutant hitchhikes with a selective sweep, and how recombination between \nthe two loci affects this process. This is compared to the neutral hitchhiking model, \nto determine how levels of linked neutral diversity would differ between the two \nscenarios. A simple application with regards to human genetic data is provided. \niii) Population subdivision can maintain costly sex, as a consequence of restricted gene \nflow slowing the spread of invading asexuals, which leads to an excessive accumulation \nof deleterious alleles. However, previous work did not quantify whether \ncostly sex can be maintained with realistic levels of population subdivision. Simulations \nin this thesis show that the level of population subdivision (as measured by \nFst) needed to maintain costly sex decreases with larger population size; however \ncritical Fst values found are generally high, compared to surveys of geographicallyclose \npopulations. The lowest levels of population subdivision that maintained sex \nwere found if mutation is both advantageous and deleterious, and demes were arranged \nin a one-dimensional stepping-stone formation. \niv) An analytical method is developed to calculate how long it takes an advantageous \nmutation (such as an invading asexual) to spread through a subdivided population. \nThe flexibility of the methods created means that they can be applied to different \ntypes of stepping-stone populations. It is shown how to formulate the fixation \ntime for one-dimensional and two-dimensional structures, with analytical methods \nshowing a good fit to simulation data.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».