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Enregistrement W1613990573 · doi:10.1212/wnl.0000000000002016

Large-scale assessment of polyglutamine repeat expansions in Parkinson disease

2015· article· en· W1613990573 sur OpenAlexfundno aff
Lisa Wang, Jan Aasly, Grazia Annesi, Soraya Bardien, Maria Bozi, Alexis Brice, Jonathan Carr, Sun Ju Chung, Carl E Clarke, David Crosiers, Angela Deutschländer, Gertrud Eckstein, Matthew J. Farrer, Stefano Goldwurm, Gaëtan Garraux, Georgios M. Hadjigeorgiou, Andrew A. Hicks, Nobutaka Hattori, Christine Klein, Beom S. Jeon, Yun Joong Kim, Suzanne Lesage, Juei-Jueng Lin, Timothy Lynch, Peter Lichtner, Anthony E. Lang, Vincent Mok, Barbara Jasińska‐Myga, George D. Mellick, Karen Morrison, Grzegorz Opala, Lasse Pihlstrøm, Peter P. Pramstaller, Sung S. Park, Aldo Quattrone, Ekaterina Rogaeva, Owen A. Ross, Leonidas Stefanis, Joanne Stockton, Peter A. Silburn, Jessie Theuns, Eng King Tan, Hiroyuki Tomiyama, Mathias Toft, Christine Van Broeckhoven, Ryan J. Uitti, Karin Wirdefeldt, Zbigniew K. Wszołek, Georgia Xiromerisiou, Kuo-Chu Yueh, Yi Zhao, Thomas Gasser, Demetrius M. Maraganore, Rejko Krüger, Manu Sharma, R.S Boyle, A Sellbach, John D. O’Sullivan, Greg T. Sutherland, G. Siebert, N. Dissanayaka, Barbara Pickut, Sebastiaan Engelborghs, Bram Meeus, Peter Paul De Deyn, Patrick Cras, Christophe Tzourio, Philippe Amouyel, Marie‐Anne Loriot, Eugénie Mutez, Aurélie Duflot, Jean-Philippe Legendre, Nawal Waucquier, Olaf Rieß, Daniela Berg, Claudia Schulte, Ana Djarmati, Johann Hagenah, Katja Lohman, Georg Auburger, Rüdiger Hilker, Simone van de Loo, Efthimios Dardiotis, Vaïa Tsimourtou, Styliani Ralli, Persa Kountra, Gianna Patramani, Cristina Vogiatzi, Manabu Funayama, Hiroyo Yoshino, Yuanzhe Li, Yoko Imamichi, Tatsushi Toda, Wataru Satake, Enza Maria Valente, Alessandro Ferraris, Bruno Dallapiccola, Tàmara Ialongo, Laura Brighina, B. Corradi, Carlo Ferrarese, Monza Roberto Piolti, Patrizia Tarantino, Ferdinanda Annesi, Monica Gagliardi, Sung Sup Park, Gabriela Kłodowska-Duda, Magdalena Boczarska‐Jedynak, Andrea Carmine Belin, Dagmar Galter, Marie Westerlund, Christer Nilsson, Andreas Puschmann, J-J Lin, J. Eric Ahlskog, Mariza de Andrade, Timothy G. Lesnick, Walter A. Rocca, Harvey Checkoway

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeDepartment of Medicine, University of TorontoHelse Sør-Øst RHFJapan Society for the Promotion of ScienceNational Medical Research CouncilMedical Research CouncilAllerganFondation pour la Recherche sur AlzheimerSt. Olavs Hospital Universitetssykehuset i TrondheimSingapore Millennium FoundationNorges ForskningsrådUniversité de LiègeChinese University of Hong KongCentre National de la Recherche ScientifiqueSeoul National UniversityUniversity of TorontoUniversity of UlsanBundesministerium für Bildung und ForschungŚląski Uniwersytet Medyczny w KatowicachMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational and Kapodistrian University of AthensHallym UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftWellcome TrustUniversity College DublinQueen Elizabeth Hospital Birmingham CharityUniversity of ThessalyInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchDuke-NUS Medical SchoolNational Institute of Environmental Health SciencesSeoul National University HospitalGriffith UniversityHelmholtz Zentrum MünchenMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchValeant Pharmaceuticals InternationalUniversiteit AntwerpenAlnylam PharmaceuticalsNovartis PharmaEuropean CommissionUniwersytet Śląski w KatowicachFritz Thyssen StiftungParkinson's UKNational Institutes of HealthUniversity Hospitals Birmingham NHS Foundation TrustInstituut Born-BungeMayo Clinic
Mots-clésTrinucleotide repeat expansionSpinocerebellar ataxiaDiseaseGeneticsMachado–Joseph diseaseOdds ratioBiologyGeneMedicineInternal medicineAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: We aim to clarify the pathogenic role of intermediate size repeat expansions of SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 as risk factors for idiopathic Parkinson disease (PD). METHODS: We invited researchers from the Genetic Epidemiology of Parkinson's Disease Consortium to participate in the study. There were 12,346 cases and 8,164 controls genotyped, for a total of 4 repeats within the SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 genes. Fixed- and random-effects models were used to estimate the summary risk estimates for the genes. We investigated between-study heterogeneity and heterogeneity between different ethnic populations. RESULTS: We did not observe any definite pathogenic repeat expansions for SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 genes in patients with idiopathic PD from Caucasian and Asian populations. Furthermore, overall analysis did not reveal any significant association between intermediate repeats and PD. The effect estimates (odds ratio) ranged from 0.93 to 1.01 in the overall cohort for the SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 loci. CONCLUSIONS: Our study did not support a major role for definite pathogenic repeat expansions in SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 genes for idiopathic PD. Thus, results of this large study do not support diagnostic screening of SCA2, SCA3, SCA6, and SCA17 gene repeats in the common idiopathic form of PD. Likewise, this largest multicentered study performed to date excludes the role of intermediate repeats of these genes as a risk factor for PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,417
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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