Preanalytic parameters in epidermal growth factor receptor mutation testing for non–small cell lung carcinoma: A review of cytologic series
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The results from molecular assays can be affected significantly by the preanalytic condition of cytologic samples. The authors review current knowledge on the use of cytologic samples for epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation testing in non-small cell lung cancer with a focus on preanalytic parameters. A systematic electronic search of the MEDLINE database was performed to identify original articles that reported the use of cytologic samples for EGFR molecular analysis and included a minimum of 100 samples. The information collected included author(s), journal, and year of publication; number of patients and samples; sampling method; type of preparation; type of fixative; staining techniques; mutation analysis techniques; tumor cellularity; the percentage of tumor cells; data on DNA quantity, quality, and concentration; failed assays; and the mutation rate. EGFR mutation analysis was conducted on 4999 cytologic samples from 22 studies that fulfilled the inclusion criteria. Fine-needle aspirates and pleural effusions were the most common types of specimens used. DNA was mainly extracted from cell blocks and smears, and the most commonly reported fixatives included formalin, ethanol, and CytoLyt. Cellularity assessments and DNA yields were available from 5 studies each. The average success rate for the assays that used cytologic specimens was 95.87% (range, 85.2%-100%). The mutation rate ranged from 6% to 50.46%, and a higher mutation detection rate and lower numbers of insufficient cases were reported for pleural effusions and lymph node samples from endobronchial ultrasound-guided transbronchial needle aspiration compared with histologic specimens. Low cellularity and a low percentage of tumor cells were associated with higher test failure rates. Future guidelines should consider the current data for specific recommendations regarding cytologic samples.
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Prédiction distillée sur la base complète
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle