Parallel evolution of histophagy in ciliates of the genus Tetrahymena
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Species of Tetrahymena were grouped into three complexes based on morphological and life history traits: the pyriformis complex of microstomatous forms; the patula complex of microstome-macrostome transformers; and the rostrata complex of facultative and obligate histophages. We tested whether these three complexes are paraphyletic using the complete sequence of the small subunit rDNA (SSrDNA). RESULTS: In addition to the 16 species of Tetrahymena whose SSrDNA sequences are known, we sequenced the complete SSrDNA from the following histophagous Tetrahymena species; Tetrahymena bergeri, Tetrahymena mobilis, Tetrahymena rostrata, and Tetrahymena setosa as well as the macrostome species Tetrahymena vorax. We also included a ciliate tentatively identified as Lambornella sp., a parasite of the mosquito Aedes sp. We confirmed earlier results using SSrDNA, which showed two distinct clusters of Tetrahymena species: the australis group and borealis group. The genetic distances among Tetrahymena are in general very small. However, all nodes were supported by high bootstrap values. With the exception of T. bergeri and T. corlissi, which are both histophagous and group as sister species, all other histophagous Tetrahymena species are most closely related to a bacterivorous species. Furthermore, Lambornella sp. and T. empidokyrea, both mosquito parasites, are sister species, although there is a considerable genetic distance between them. CONCLUSIONS: There has been parallel evolution of histophagy in the genus Tetrahymena and the three classical species complexes are paraphyletic. As the genus Lambornella arises within the Tetrahymena clade, it is not likely a defensible one.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».