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Enregistrement W1630518968 · doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03432.x

Structure, mRNA expression and linkage mapping of the brain‐type fatty acid‐binding protein gene (<i>fabp7</i>) from zebrafish (<i>Danio rerio</i>)

2003· article· en· W1630518968 sur OpenAlexafffund
Rong‐Zong Liu, Eileen M. Denovan‐Wright, Jonathan Wright

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchKillam Trusts
Mots-clésZebrafishBiologyExonMolecular biologyGeneDanioIntronMessenger RNAGene expressionComplementary DNACoding regionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The brain fatty acid-binding protein (B-FABP) is involved in brain development and adult neurogenesis. We have determined the sequence of the gene encoding the B-FABP in zebrafish. The zebrafish B-FABP gene spans 2370 bp and contains four exons interrupted by three introns. The coding sequence of zebrafish B-FABP gene is identical to its cDNA sequence and the coding capacity of each exon is the same as that for the human and mouse B-FABP genes. A 1249 bp sequence 5' upstream of exon 1 of the zebrafish B-FABP gene was cloned and sequenced. Several brain development/growth-associated transcription factor binding elements, including POU-domain binding elements and the proposed lipogenic-associated transcription factor NF-Y elements, were found within the 5' region of the B-FABP gene. RT-PCR analysis using mRNA extracted from different tissues of adult zebrafish demonstrated that the zebrafish B-FABP mRNA was predominant in brain with lower levels in liver, testis and intestine, but not in ovary, skin, heart, kidney and muscle. Quantitative RT-PCR revealed a similar tissue-specific distribution for zebrafish B-FABP mRNA except that very low levels of B-FABP mRNA, normalized to beta-actin mRNA, were detected in the heart and muscle RNA, but not in liver RNA. Zebrafish B-FABP mRNA was detected by RT-PCR in embryos beyond 12 h postfertilization, suggesting a correlation of zebrafish B-FABP mRNA expression with early brain development. Radiation hybrid mapping assigned the zebrafish B-FABP gene to linkage group 17. Conserved syntenies of the zebrafish B-FABP gene and the human and mouse orthologous B-FABP genes were observed by comparative genomic analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,861

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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