<i>Salmonella typhimurium</i> Infection and Lipopolysaccharide Stimulation Induce Similar Changes in Macrophage Gene Expression
Notice bibliographique
Résumé
Changes in macrophage phenotype induced during infection result from the recognition of bacterial products as well as the action of bacterial virulence factors. We used the unprecedented opportunity provided by gene arrays to simultaneously study the expression of hundreds of genes during Salmonella typhimurium infection of macrophages and to assess the contribution of the bacterial virulence factor, LPS, in initiating the host responses to Salmonella. We found that S. typhimurium infection caused significant changes in the expression of numerous genes encoding chemokines, cell surface receptors, signaling molecules, and transcriptional activators at 4 h postinfection of the RAW 264.7 murine macrophage cell line. Our results revealed changes in the expression of several genes that had not been previously implicated in the host responses to S. typhimurium infection, as well as changes in the expression of several genes previously shown to be regulated by S. typhimurium infection. An overlapping spectrum of genes was expressed in response to virulent S. typhimurium and purified S. typhimurium LPS, reinforcing the major role of this surface molecule in stimulating the early response of macrophages to bacterial infection. The macrophage gene expression profile was further altered by activation with IFN-gamma, indicating that host cell responses depend on the activation state of the cell.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».