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Enregistrement W1633895629 · doi:10.1128/9781555815523.ch5

Essential Genes in<i>Aspergillus fumigatus</i>

2014· book-chapter· km· W1633895629 sur OpenAlex
Wenqi Hu, Bo Jiang, Terry Roemer

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Languekm
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAspergillus fumigatusBiologyGeneCandida albicansGeneticsAntifungal drugComputational biologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter discusses recent developments in the identification of essential genes and validation of potential antifungal drug targets in Aspergillus fumigatus. Essential genes were identified based on (i) the inability to construct haploid insertional mutants or (ii) identification of temperature-sensitive conditional mutants. The compendium of recently defined conserved essential genes in Saccharomyces cerevisiae, Candida albicans, and other fungi has provided important insights for predicting essential genes in A. fumigatus. Essential genes that are required for fungal survival and growth provide potential antifungal drug targets. A. fumigatus genes which have been experimentally demonstrated to be essential for growth are summarized. This essential gene set includes genes involved in various biological and biochemical functions, such as amino acid, cell wall, ergosterol, heme, and lipid biosynthesis, as well as cell cycle control, cellular metabolism, protein transport, ribosome biogenesis, and RNA splicing. Additional A. fumigatus essential genes involved in ergosterol biosynthesis include ERG10, ERG12, ERG7, ERG8, and ERG20 and as such, provide new targets for therapeutic intervention. Currently, identification of A. fumigatus essential genes largely depends on the following four approaches: conventional gene deletion and disruption, parasexual genetics, RNAi knockdown, and conditional promoter replacement strategies. Completion of the A. fumigatus genome sequence, however, combined with current molecular genetic strategies and their inevitable refinements, has now made large-scale genetic analysis of A. fumigatus possible for the first time, thus expanding our knowledge of its biology, pathogenesis, and potential antifungal targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,962
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle