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Enregistrement W164039747 · doi:10.1007/978-1-61779-204-5_6

In Vitro Assay for Protease Activity of Proprotein Convertase Subtilisin Kexins (PCSKs): An Overall Review of Existing and New Methodologies

2011· review· en· W164039747 sur OpenAlexafffund
Ajoy Basak, Andrew Chen, Swapan Majumdar, Heather Palmer Smith

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSubtilisinProprotein convertaseProteaseKexinProprotein ConvertasesBiochemistryCleaveFurinEnzymeIn vitroBiologyProteolysisChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian proprotein convertase subtilisin kexins (PCSKs) previously called proprotein or prohormone convertases (PCs) are a family of Ca(+2)-dependent endoproteases in the subtilisin family. These proteolytic enzymes exert their many crucial physiological and biological functions in vivo via their ability to cleave larger inactive precursor proteins into their biologically active mature forms. This event takes place in a highly efficient and selective manner. Such actions of PCSKs either alone or in combination to cleave specific protein bonds are the hallmark events that not only define the normal functions and metabolism of the body but also may lead to a variety of diseases or disorders with associated conditions. These include among others, diabetes, obesity, cancer, cardiovascular diseases, reproduction abnormalities as well as viral bacterial infections. These conditions were the direct consequences of an enhanced level of enzymatic activity of one or more PCSKs except only PCSK9, whose protease activity in relation to its physiological substrate has yet to be characterized. Owing to this finding, a large number of research studies have been exclusively devoted to develop rapid, efficient and reliable in vitro methods for examining the protease activity of these enzymes. Several assays have been developed to monitor PCSK activity and these are widely used in chemical, biochemical, cellular and animal studies. This review will cover various methodologies and protocols that are currently available in the literature for PCSK activity assays. These include liquid phase methods using fluorogenic, chromogenic and intramolecularly quenched fluorescent substrates as well as a newly developed novel solid phase fluorescence method. This review will also highlight the usefulness of these methodologies and finally a comparative analysis has been made to examine their merits and demerits with some key examples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,207
Tête enseignante GPT0,481
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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