Transcription factors Sp1 and C/EBP regulate <i>NRAMP1</i> gene expression
Notice bibliographique
Résumé
The natural resistance-associated macrophage protein 1 (Nramp1), which belongs to a conserved family of membrane metal transporters, contributes to phagocyte-autonomous antimicrobial defense mechanisms. Genetic polymorphisms in the human NRAMP1 gene predispose to susceptibility to infectious or inflammatory diseases. To characterize the transcriptional mechanisms controlling NRAMP1 expression, we previously showed that a 263 bp region upstream of the ATG drives basal promoter activity, and that a 325 bp region further upstream confers myeloid specificity and activation during differentiation of HL-60 cells induced by vitamin D. Herein, the major transcription start site was mapped in the basal region by S1 protection assay, and two cis-acting elements essential for myeloid transactivation were characterized by in vitro DNase footprinting, electrophoretic mobility shift experiments, in vivo transfection assays using linker-mutated constructs, and chromatin immunoprecipitation assays in differentiated monocytic cells. One distal cis element binds Sp1 and is required for NRAMP1 myeloid regulation. Another site in the proximal region binds CCAAT enhancer binding proteins alpha or beta and is crucial for transcription. This study implicates Sp1 and C/EBP factors in regulating the expression of the NRAMP1 gene in myeloid cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».