Perfis fenotípicos e detecção de genes alvo por PCR em isolados de diferentes origens e cepas de referência identificados como Cronobacter spp. (Enterobacter sakazakii)
Notice bibliographique
Résumé
Cronobacter (Enterobacter sakazakii) é um novo gênero da família Enterobacteriaceae, reconhecido como responsável pelo elevado número de casos fatais em neonatos após consumo de fórmulas infantis. Os métodos convencionais de detecção desses micro-organismos são demorados e de sensibilidade inadequada. A ISO/TS 22964:2006 é a metodologia padronizada mais recentemente para detecção de Cronobacter. Este estudo teve como objetivo identificar como Cronobacter spp. os isolados brasileiros previamente classificados como E. sakazakii, comparar as características de 37 culturas de Cronobacter e não-Cronobacter e avaliar os kits miniaturizados e a ISO/TS 22964:2006. Foi também desenvolvido um protocolo convencional de PCR com alvo em dnaG. A maioria dos isolados brasileiros não foi confirmada como Cronobacter spp., e o enriquecimento seletivo da metodologia ISO foi inibitório para algumas cepas de Cronobacter. O kit ID 32E demonstrou desempenho mais confiável. O protocolo de PCR com alvo em gluA apresentou resultados consistentes com o ID 32E, e o protocolo com alvo em dnaG foi 100% sensível e específico. Portanto, os protocolos de PCR com alvo em gluA e dnaG podem ser usados para complementar a detecção e identificação de Cronobacter spp. após o emprego de métodos de isolamento e identificação convencionais.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».