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Enregistrement W1644253690 · doi:10.53393/rial.2012.71.32386

Perfis fenotípicos e detecção de genes alvo por PCR em isolados de diferentes origens e cepas de referência identificados como Cronobacter spp. (Enterobacter sakazakii)

2012· article· pt· W1644253690 sur OpenAlexfundno aff
Márcia Barbosa Warnken, Marcelo Luiz Lima Brandão, Aline Encarnação Souza, Célia Maria Carvalho Pereira Araulo Romão, Ana Cristina Martins Almeida Nogueira, Maria Teresa Destro

Notice bibliographique

RevueREVISTA DO INSTITUTO ADOLFO LUTZ · 2012
Typearticle
Languept
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnterobacteriaceae and Cronobacter Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHealth CanadaUniversidade do Estado do Rio de JaneiroFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroUniversity College Dublin
Mots-clésCronobacterCronobacter sakazakiiBiologyMolecular biologyEnterobacterMicrobiologyFood scienceGeneGeneticsEscherichia coliInfant formula

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cronobacter (Enterobacter sakazakii) é um novo gênero da família Enterobacteriaceae, reconhecido como responsável pelo elevado número de casos fatais em neonatos após consumo de fórmulas infantis. Os métodos convencionais de detecção desses micro-organismos são demorados e de sensibilidade inadequada. A ISO/TS 22964:2006 é a metodologia padronizada mais recentemente para detecção de Cronobacter. Este estudo teve como objetivo identificar como Cronobacter spp. os isolados brasileiros previamente classificados como E. sakazakii, comparar as características de 37 culturas de Cronobacter e não-Cronobacter e avaliar os kits miniaturizados e a ISO/TS 22964:2006. Foi também desenvolvido um protocolo convencional de PCR com alvo em dnaG. A maioria dos isolados brasileiros não foi confirmada como Cronobacter spp., e o enriquecimento seletivo da metodologia ISO foi inibitório para algumas cepas de Cronobacter. O kit ID 32E demonstrou desempenho mais confiável. O protocolo de PCR com alvo em gluA apresentou resultados consistentes com o ID 32E, e o protocolo com alvo em dnaG foi 100% sensível e específico. Portanto, os protocolos de PCR com alvo em gluA e dnaG podem ser usados para complementar a detecção e identificação de Cronobacter spp. após o emprego de métodos de isolamento e identificação convencionais.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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