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Enregistrement W1645698456 · doi:10.4049/jimmunol.179.1.256

The Transcription Factor Wilms Tumor 1 Regulates Matrix Metalloproteinase-9 through a Nitric Oxide-Mediated Pathway

2007· article· en· W1645698456 sur OpenAlexaff
Marcelo Marcet‐Palacios, Marina Ulanova, Florentina Duta, Lakshmi Puttagunta, Samira Muñoz-Cruz, Derrick Gibbings, Marek W. Radomski, Lisa Cameron, Irvin Mayers, A. Dean Befus

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensTrinity CollegeLakehead UniversityUniversity of Alberta HospitalNOSM UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatin immunoprecipitationGene knockdownTranscription factorMolecular biologyBiologyRepressorSmall interfering RNAPromoterMatrix metalloproteinaseTranscription (linguistics)Chromosomal translocationCancer researchGene expressionGeneRNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) is released by human lung epithelial cells (LEC) in conditions such as asthma and chronic obstructive pulmonary disease and expression of MMP-9 correlates with the severity of these disorders. MMP-9 production has been reported to be regulated by a NO/soluble guanylate cyclase-dependent pathway. Transcriptional regulation of this enzyme, however, is poorly understood. Using phylogenetic analysis, we observed a highly conserved sequence in the 5' flanking region of the MMP-9 gene containing binding sites for the transcription factor Wilms tumor 1 (WT1). We confirmed the presence of WT1 in human LEC and that treatment with TNF or a mixture containing LPS, PMA, and IFN-gamma resulted in translocation of WT1 from the nucleus to the cytosol. This translocation coincided with increased expression of MMP-9 and could be blocked by inhibitors of the NO/soluble guanylate cyclase pathway. WT1 knockdown using small-interfering RNA up-regulated MMP-9 expression in the presence of the NO synthase inhibitor 1400W. Using either WT1 pulldown with probes for the conserved region of the MMP-9 promoter or chromatin immunoprecipitation, we confirmed WT1 binding to the MMP-9 promoter. These findings indicate WT1 is a repressor of MMP-9, regulated by a NO-mediated pathway in human LEC. To our knowledge, this is the first report of WT1 regulating MMP-9 expression. Further study is needed to determine whether clinical conditions exhibiting tissue remodeling, such as asthma and/or chronic obstructive pulmonary disease, demonstrate reduced levels of WT1 or its repressor activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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