Cloning and functional characterization of <i>Xenopus laevis</i> facilitated hexose transporters GLUT2 and GLUT4 (XL‐GLUT2, XL‐GLUT4).
Notice bibliographique
Résumé
RT‐PCR was used to clone members of the facilitated hexose transporter gene family (SLC2A) from Xenopus oocyte total RNA. Gene specific primers were designed using the NIH Xenopus Gene Collection. We have identified two Xenopus GLUT sequences, XL‐GLUT2 and XL‐GLUT4 (gene accession numbers EF102088 & EF102089 ) which have 62% & 69% identity and 78% & 83% similarity with their human orthologues, respectively. Functional characterization of XL‐GLUT2 shows that this protein transports 2‐deoxyglucose > galactose > glucose > 3‐O‐methyl glucose >> fructose. In contrast, hGLUT2 has an equal affinity for both glucose and fructose (Km > 20mM) while XL‐GLUT2 has a much higher affinity, for glucose alone with a Km of 2.5 ± 0.5 mM. Sequence alignment and comparison of the Xenopus and human transporters in the region of their predicted 7th transmembrane helix shows that several motifs are highly conserved, in particular the QLS and the NXV/I sequences. This latter hydrophobic motif has previously been found to influence substrate specificity in human GLUTs. hGLUT2 has the motif NGI which when mutated to NGV results in an almost complete loss of fructose transport, however, the Xenopus WT protein has very low fructose transport capacity, yet still has the NGI motif. This suggests that this hydrophobic region found near the exofacial opening of the transport pore of GLUT proteins is not the sole determinant of substrate specificity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».