Association of SNP rs17465637 on Chromosome 1q41 and rs599839 on 1p13.3 with Myocardial Infarction in an American Caucasian Population
Notice bibliographique
Résumé
Recent genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) association studies (GWAS) have identified a number of SNPs that were significantly associated with coronary artery disease and myocardial infarction (MI). However, many independent replication studies in other populations are needed to unequivocally confirm the GWAS association. To assess GWAS association, we have established a case-control cohort consisting of 1231 well-characterised MI patients and 560 controls without detectable coronary stenosis, all selected from the Cleveland Genebank population. The Genebank cohort has sufficient power to detect the association between MI and four GWAS SNPs, including rs17465637 within the MIA3 gene, rs2943634 (intergenic), rs6922269 in MTHFD1L, and rs599839 near SORT1. SNPs were genotyped by TaqMan assays and follow-up multivariate logistic regression analysis with incorporation of significant covariates showed significant association with MI for MIA3 SNP rs17465637 (P-adj= 0.0034) and SORT1 SNP rs599839 (P-adj= 0.009). The minor allele G of rs599839 was also associated with a decreased LDL-C level of 5-9 mg/dL per allele, but not with HDL-C or triglyceride levels. No association for MI or lipid levels was found for SNPs rs2943634 and rs6922269 (P-adj > 0.05). Our results establish two SNPs, rs17465637 in MIA3 and rs599839 near SORT1 as significant risk factors for MI in the American Genebank Caucasian population.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».