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Enregistrement W1658721397 · doi:10.1096/fasebj.29.1_supplement.568.33

Regulation of Yeast Glycerol‐3‐Phosphate Acyltransferase Gpt2p/Gat1p Through Phosphorylation

2015· article· en· W1658721397 sur OpenAlexaff
Brittney Shabits, Bernadette Nagler, Karin Athenstaedt, Vanina Zaremberg

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryPhosphatidic acidPhosphorylationOleic acidAcyltransferaseChemistryCell biologyMutantBiologyYeastEnzymeGenePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerol‐3‐phosphate acyltransferases (GPAT) catalyze the acylation of glycerol‐3‐phosphate, the first and rate limiting reaction in de novo synthesis of phosphatidic acid (PA). GPAT redundancy led to the hypothesis that isoenzymes are forming different PA pools which supply different pathways. In the model organism S. cerevisiae two GPATs have been identified, Gpt2 and Sct1. Most recently we demonstrated the important role of Gpt2 (but not Sct1) in cells challenged by oleic acid as the only carbon source. Whereas growth in oleic acid normally induces lipid particle accumulation, cells lacking GPT2 failed to accumulate these neutral lipids storage compartments, exhibited a strong growth defect, and cell viability was reduced. The fact that the intracellular distribution of Gpt2 and its phosphorylation status changed under this growth condition attracted our interest. We have identified 3 highly conserved phosphorylation sites in Gpt2 by mass spectrometry, localized to a Ser rich region in the carboxy‐end. Ser to Ala triple mutations as well as deletion of the Ser rich region, were introduced in the yeast genome to investigate the role of phosphorylation in the regulation of Gpt2. Importantly, both Gpt2 mutant forms retain enzymatic activity sufficient to support life of cells lacking Sct1. Microscopic inspection of phosphomutants revealed changes in lipid droplet formation. In line, cells overproducing these mutants exacerbated this phenotype, suggesting that lack of Gpt2 phosphorylation leads to abnormal accumulation of lipid droplets and carbon source consumption. The role of the Gpt2 serine‐rich carboxy‐end in mediating protein‐protein interactions is currently investigated

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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