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Enregistrement W166317910 · doi:10.3978/j.issn.2218-6751.2014.06.09

Prognostic markers in lung cancer: is it ready for prime time?

2014· review· en· W166317910 sur OpenAlexaff
Chang‐Qi Zhu, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASLung cancerGenemicroRNAMicroarrayCancerMedicineBiologyOncologyCancer researchGene expressionBioinformaticsMutationInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-small cell lung cancer (NSCLC) is a heterogeneity disease and to date, specific clinical factors and tumor stage are established as prognostic markers. Nevertheless, prognosis within stage may vary significantly. During the last 3 decades, genes/proteins that drive tumor initiation and progression, such as oncogenes and tumor suppressor genes have been studied as additional potential prognostic markers. The protein markers as evaluated by immunohistochemistry (IHC) have previously dominated these studies. However, with the development of high-throughput techniques to interrogate genome wide genetic or gene expression changes, DNA (copy number and mutation) and RNA (mRNA and microRNA) based markers have more recently been studied as prognostic markers. Largely due to the heterogeneity and complexity of NSCLC, single gene markers including KRAS mutation has not been validated as strong prognostic markers. In contrast, several gene expression signatures representing mRNA levels of multiple genes have been developed and validated in multiple microarray datasets of independent patient cohorts. The salient features of these gene signatures and their potential value to predict benefit from adjuvant chemotherapy is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,938
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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