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Enregistrement W1664253928 · doi:10.1111/j.1742-4658.2010.07813.x

The <i>Promyelocytic Leukemia Zinc Finger</i> (<i>PLZF </i>) gene is a novel transcriptional target of the CCAAT‐Displacement‐Protein (CUX1) repressor

2010· article· en· W1664253928 sur OpenAlexafffund
Isabelle Fréchette, Mathieu Darsigny, Karine Brochu‐Gaudreau, Christine M. Jones, François Boudreau

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Texas Southwestern Medical CenterUniversity of Pennsylvania
Mots-clésBiologyRepressorWnt signaling pathwayZinc fingerMolecular biologyGeneGene expressionCancer researchCell biologyTranscription factorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CCAAT-Displacement-Protein (CUX1) can transcriptionally repress sucrase–isomaltase gene expression, a specific product of enterocytes that becomes re-expressed during human colonic polyposis. Little is known of the gene repertoire that is directly affected by CUX1 in the intestinal epithelial context. This article identifies the Promyelocytic Leukemia Zinc Finger (PLZF) gene as a transcriptional target for the CUX1 repressor. CUX1 interacts in vivo with multiple DNA-binding sites in the 5′-UTR and promoter of the PLZF gene in colorectal cancer cells, a region that is functionally targeted by CUX1 in cotransfection assays. PLZF was found to be induced in colorectal cancer cell lines, correlating with a low detectable level of CUX1, a pattern that was reversed in normal human colonocytes. Reduction of p200CUX1 expression by RNAi in the Caco-2/15 cell line increased PLZF gene transcript expression. Because of the implication of Plzf in the regulation of stem cell maintenance, as well as Wnt and Ras signaling, in other systems, our observations suggest that the novel genetic relationship between CUX1 and PLZF could be of relevance to human diseases, such as leukemia, and open up a new field of investigation for the implication of these regulators during intestinal polyposis and cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,284
Score d'incertitude au seuil0,387

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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