Interleukin 28B polymorphisms are the only common genetic variants associated with low‐density lipoprotein cholesterol (LDL‐C) in genotype‐1 chronic hepatitis C and determine the association between LDL‐C and treatment response
Notice bibliographique
Résumé
Low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) levels and interleukin 28B (IL28B) polymorphism are associated with sustained viral response (SVR) to peginterferon/ribavirin (pegIFN/RBV) for chronic hepatitis C (CHC) infection. IL28B has been linked with LDL-C levels using a candidate gene approach, but it is not known whether other genetic variants are associated with LDL-C, nor how these factors definitively affect SVR. We assessed genetic predictors of serum lipid and triglyceride levels in 1604 patients with genotype 1 (G1) chronic hepatitis C virus (HCV) infection by genome-wide association study and developed multivariable predictive models of SVR. IL28B polymorphisms were the only common genetic variants associated with pretreatment LDL-C level in Caucasians (rs12980275, P = 4.7 × 10(-17), poor response IL28B variants associated with lower LDL-C). The association was dependent on HCV infection, IL28B genotype was no longer associated with LDL-C in SVR patients after treatment, while the association remained significant in non-SVR patients (P < 0.001). LDL-C was significantly associated with SVR for heterozygous IL28B genotype patients (P < 0.001) but not for homozygous genotypes. SVR modelling suggested that IL28B heterozygotes with LDL-C > 130 mg/dL and HCV RNA ≤600 000 IU/mL may anticipate cure rates >80%, while the absence of these two criteria was associated with an SVR rate of <35%. IL28B polymorphisms are the only common genetic variants associated with pretreatment LDL-C in G1-HCV. LDL-C remains significantly associated with SVR for heterozygous IL28B genotype patients, where LDL-C and HCV RNA burden may identify those patients with high or low likelihood of cure with pegIFN/RBV therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».