MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1666676049 · doi:10.1212/wnl.82.10_supplement.p6.018

A Rare Case of Microcephaly-Capillary Malformation Syndrome Diagnosed via Whole Exome Sequencing (P6.018)

2014· article· en· W1666676049 sur OpenAlexaboutno aff
Nassim Zecavati, Reem Saadeh‐Haddad, César Santos, Chahira Kozma

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocephalyExome sequencingMedicineExomePediatricsGeneticsMutationBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: To describe the role of Whole Exome Sequencing in diagnosing a rare case of Microcephaly-Capillary Malformation (MIC-CAP) Syndrome. Background: MIC-CAP Syndrome is a rare autosomal recessive syndrome characterized by profound microcephaly, cutaneous capillary malformations, severe developmental delay and intractable epilepsy. To date, there have been approximately 12 cases described world-wide. In this abstract, we describe the role of whole exome sequencing in uncovering this rare neurogenetic syndrome. Design/Methods: Clinical data were extracted via detailed chart review. Whole exome sequencing was performed and independently verified at two institutions. Results: The proband, a 2 day old male infant was born at 39 weeks. Prenatal care was unremarkable. Apgars were 9 and 9 at 1 and 5 minutes, respectively. He was noted to have several macules on his body. At 24 hours of life, he developed clinical and subclinical seizures, refractory to anti-epileptic drugs. Testing was ultimately carried out at the Children’s Hospital of Eastern Ontario Research Institute, Inc. Simultaneously, whole genome sequencing was initiated at the Baylor College of Medicine. At age 5 months, results were received from the research laboratory confirming 2 mutations in the STAMBP gene. The first mutation c299T>A results in a p.Phe100Tyr occurs at a highly conserved amino acid position and has been reported before by the lab as a mutation in another affected individual. The second mutation is a c.753_754insT and creates a nonsense mutation. These findings were verified by whole exome sequencing at Baylor College of Medicine. Both parents were confirmed as carriers. Discussion: Whole exome sequencing (WES) was successful in identifying 2 mutations known to result in MIC-CAP Syndrome, a rare neurogenetic syndrome characterized by severe microcephaly, developmental delay, intractable epilepsy, and cutaneous hemangiomas. WES appears to be a promising tool for identifying rare neurogenetic syndromes for which more targeted sequencing is unavailable. Though the process is lengthy (15 weeks), WES offers families and providers a valuable tool in diagnosing rare neurogenetic syndromes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeurologyMême sujetGenetic and Kidney Cyst DiseasesTravaux en français237 207