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Enregistrement W1667593033 · doi:10.1111/j.1742-4658.2012.08692.x

Enzymatic synthesis of valerena‐4,7(11)‐diene by a unique sesquiterpene synthase from the valerian plant (<i>Valeriana</i> <i>officinalis</i>)

2012· article· en· W1667593033 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and biochemical processes
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesGenome AlbertaGenome CanadaRural Development AdministrationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of AlbertaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationMcGill University
Mots-clésValerianTerpeneSesquiterpeneGermacreneTerpenoidBiologyMedicinal plantsTraditional medicineBotanyChemistryBiochemistryStereochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Valerian (Valeriana officinalis) is a popular medicinal plant in North America and Europe. Its root extract is commonly used as a mild sedative and anxiolytic. Among dozens of chemical constituents (e.g. alkaloids, iridoids, flavonoids, and terpenoids) found in valerian root, valerena-4,7(11)-diene and valerenic acid (C15 sesquiterpenoid) have been suggested as the active ingredients responsible for the sedative effect. However, the biosynthesis of the valerena-4,7(11)-diene hydrocarbon skeleton in valerian remains unknown to date. To identify the responsible terpene synthase, next-generation sequencing (Roche 454 pyrosequencing) was used to generate ∼ 1 million transcript reads from valerian root. From the assembled transcripts, two sesquiterpene synthases were identified (VoTPS1 and VoTPS2), both of which showed predominant expression patterns in root. Transgenic yeast expressing VoTPS1 and VoTPS2 produced germacrene C/germacrene D and valerena-4,7(11)-diene, respectively, as major terpene products. Purified VoTPS1 and VoTPS2 recombinant enzymes confirmed these activities in vitro, with competent kinetic properties (K(m) of ∼ 10 μm and k(cat) of 0.01 s(-1) for both enzymes). The structure of the valerena-4,7(11)-diene produced from the yeast expressing VoTPS2 was further substantiated by (13) C-NMR and GC-MS in comparison with the synthetic standard. This study demonstrates an integrative approach involving next-generation sequencing and metabolically engineered microbes to expand our knowledge of terpenoid diversity in medicinal plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,798

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle