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Enregistrement W1670883673 · doi:10.1002/9780470015902.a0000544.pub3

Protein Synthesis Initiation in Eukaryotes:<scp>IRES</scp>‐mediated Internal Initiation

2015· other· en· W1670883673 sur OpenAlexaff
Yuri V. Svitkin, Nadeem Siddiqui, Nahum Sonenberg

Notice bibliographique

RevueEncyclopedia of Life Sciences · 2015
Typeother
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInternal ribosome entry siteEIF4EEukaryotic initiation factorInitiation factorTranslation (biology)RibosomeEukaryotic translationCell biologyBiologyEukaryotic translation initiation factor 4 gammaMessenger RNARNAProtein biosynthesisEukaryotic RibosomeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The major mechanism of translation initiation in eukaryotes involves recognition of the cap structure at the 5′ end of the mRNA by the cap‐binding protein eIF4E. Internal ribosome entry sites (IRES) are specialised RNA sequences that are capable of recruiting ribosomes to an internal position of an mRNA in a cap‐independent manner. Many viruses have evolved this alternative pathway to initiate translation. Viral IRESs bind ribosomes by several mechanisms that require different sets of canonical initiation factors. In addition, IRES activity is modulated by IRES trans‐acting factors (ITAFs). Some cellular mRNAs are suggested to contain IRESs, as they function in cells under stress and other conditions when cap‐dependent initiation is inhibited. However, solid evidence for internal ribosome entry onto many of these mRNAs is lacking. Key Concepts In eukaryotes, the majority of mRNAs are translated by a 5′ end‐dependent mechanism, in which the mRNA 5′ cap structure recruits the translation machinery. Specific RNA elements, termed internal ribosome entry sites (IRESs), can direct ribosomes to internal positions of mRNAs to initiate translation. IRESs in viral RNA genomes differ significantly with respect to their structure and initiation factor requirements. In addition to some canonical initiation factors, IRES‐mediated translation may require ITAFs (IRES trans ‐acting factors). Many cellular mRNAs are suggested to possess IRESs, as they remain active under a number of pathophysiological stress conditions when cap‐dependent translation is inhibited. The authenticity of some cellular IRESs remains controversial as being not confirmed in recently developed stringent tests for IRES activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,318
Score d'incertitude au seuil0,800

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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