Genetics of Susceptibility to Mycobacterial Disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The genus Mycobacteria contains important pathogens of humans including Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium leprae . The outcome of mycobacterial infection is influenced by variations in human genes. Genetic susceptibility to mycobacteria involves multiple genes that contribute to the innate immune recognition of mycobacteria (genes coding for pattern recognition receptors), recognition of mycobacteria by the adaptive immune system involving products of human leucocyte antigen/major histocompatibility complex genes and effector responses of the immune system (genes affecting cytokines, chemokines and immunomodulators). Host genetic susceptibility to pathogens is complicated by the genetics of pathogen, gene‐environment and gene–gene interactions. Moreover, ethnicity specific effects further add fuel to the complication. A series of concerted comprehensive immunogenetic studies are warranted to decipher new molecular players and delineate complex host–pathogen interactions. This might identify the genetic factors that are definitely associated with mycobacterial diseases and could lead to development of novel therapeutics and prophylaxis. Convergence of immunogenomics, pharmacogenomics and vaccinomics could yield better tools to tackle these dreadful diseases of mankind. Key Concepts: Outcome of a mycobacterial infection depends on gender, age, HIV infection status, malnutrition, BCG vaccination, host immune responses, pathogen variation and host genetics, which varies according to ethnicity. Extensive studies have implicated the role of alleles from human leucocyte antigen (HLA) genes/major histocompatibility complex (MHC) genes and single nucleotide polymorphisms (SNPs) of various non‐HLA genes/non‐MHC genes in conferring susceptibility to mycobacterial disease. Polymorphisms in the genes coding for pattern recognition receptors such as toll‐like receptors, mannose‐binding lectins, mannose receptors, surfactant proteins and DC‐SIGN affect susceptibility to mycobacterial disease. HLA‐DRB1 * 15 and HLA‐DQB1 alleles having aspartic acid at β57 have been shown to be associated with TB in many populations. SNPs in the genes coding for IFNG , IL10 , CCL2 , vitamin D receptor, NOS2A and other effector molecules influence susceptibility to mycobacterial disease. SNPs in the genes coding for immune mediators could predict response to treatment. Ethnicity specific effects, and strain variation in the pathogen, gene–gene and gene–environment interactions affect genetic susceptibility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».