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Enregistrement W1684490239 · doi:10.1139/g07-053

Genetic mapping of genes for susceptibility to black spot disease in Japanese pears

2007· article· en· W1684490239 sur OpenAlexvenueno aff
Shingo Terakami, Yukio Adachi, Hiroyuki Iketani, Yoshihiko Sato, Y. Sawamura, Norio Takada, Chikako Nishitani, Takatsugu Yamamoto

Notice bibliographique

RevueGenome · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPEARBiologyBlack spotGeneticsGeneGenetic linkagePlant disease resistanceAlternaria alternataMicrosatelliteGenetic markerBotanyHorticultureAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Black spot disease, which is caused by the Japanese pear pathotype of Alternaria alternata (Fr.) Keissler, is one of the most harmful diseases in Japanese pear cultivation. We identified the exact positions and linkage groups (LGs) of the genes for susceptibility to black spot in the Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai) cultivars 'Osa Nijisseiki' (gene Ani) and 'Nansui' (gene Ana). Segregation of susceptibility and resistance fitted the expected ratio of 1:1 in progeny of 'Nansui' but showed a slight distortion in progeny of 'Osa Nijisseiki'. We mapped the genes for susceptibility to black spot in both populations using a genome scanning approach. The simple sequence repeat (SSR) markers CH04h02 and CH03d02 showed tight linkage to Ani and Ana. Although Ani and Ana are derived from different sources, both genes are located at the top region of LG 11. Information about the positions of the susceptibility genes and the molecular markers linked to them will be useful for marker-assisted selection in pear breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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