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Enregistrement W1684597668 · doi:10.1111/j.1529-8817.2004.03102.x

PURIFICATION AND CHARACTERIZATION OF THE 20S PROTEASOME FROM THEALGA <i>CHARA CORALLINA</i> (CHAROPHYCEAE)<sup>1</sup>

2004· article· en· W1684597668 sur OpenAlexaff
Yuji Moriyasu, Ladislav Malek

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensLakehead University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChymotrypsinIsoelectric pointBiochemistryBiologyIsoelectric focusingProteasomeTrypsinMolecular massProteolysisChromatographyPolyacrylamide gel electrophoresisEnzymeChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We purified the 20S proteasome from the alga Chara corallina Willd with DEAE–ion‐exchange column chromatography and preparative nondenaturing PAGE. The analysis of the purified enzyme bynondenaturing PAGE gave a single band whose molecular mass was estimated to be about 600,000 Da by gel permeation chromatography and whose isoelectric point was at pH 5.5. Two‐dimensional gel electrophoresis gave at least 12 spots with molecular masses from 26,000 to 32,000 Da in a wide range of isoelectric points. The 20S proteasome hydrolyzed three types of artificial substrates used to differentiate chymotrypsin‐like, trypsin‐like, and peptidyl glutamyl peptidase activities. Both the chymotrypsin‐like and the peptidyl glutamyl peptidase activities were enhanced by SDS. In the presence of 0.03% SDS, the optimal pH for both activities was 8.5. Trypsin‐like activity of the 20S proteasome had a broad pH optimum in an alkaline region and was not activated but inhibited by SDS. Its chymotrypsin‐like activity was inhibited by N ‐ethylmaleimide, p ‐chloromercuribenzoic acid, and chymostatin. In contrast, its peptidyl glutamyl peptidase activity was not inhibited by chymostatin. Moreover, proteasome inhibitors MG 115 and MG 135 were effective against the chymotrypsin‐like activity and less so against the peptidyl glutamyl peptidase activity. These properties were very similar to those of the proteasomes of mammalian, yeast, and spinach cells. The large size of Chara cells will make in vivo manipulations and investigations of the proteasome proteolytic system possible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,335

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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