Investigations of 5S rDNA of <i>Vitis vinifera</i> L.: sequence analysis and physical mapping
Notice bibliographique
Résumé
Here we report the first results of a study of 5S rDNA of Vitis vinifera. 5S rDNA sequences from seven genotypes were amplified by PCR, cloned, and sequenced. Three types of repeats were found. Two variants, denominated long repeat and short repeat, appeared to be the main components of the 5S rDNA of this species, since they were found in all genotypes analyzed. They differed markedly from each other in both the length and the nucleotide composition of the spacers. The third variant, classified as DEL short repeat, differs from the short repeat owing to a large deletion in the spacer region. It appears to be the most recent repeat type, since it was identified in only one genotype. The organization of the 5S rDNA repeat unit variants was investigated by amplifying the genomic DNA with primers designed on the sequence of the long and short spacers. The PCR-amplified fragments showed that the long repeat is associated with the other two repeats, indicating that in V. vinifera different repeat units coexist within the same tandem array. FISH analysis demonstrated that 5S rRNA genes are localized at a single locus. The variability of 5S rDNA repeats is discussed in relation to the putative allopolyploid origin of V. vinifera.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».