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The use of Silver-stained “Comets” to Visualize DNA Damage and Repair in Normal and Xeroderma pigmentosum Fibroblasts After Exposure to Simulated Solar Radiation

2000· article· en· W1693520481 sur OpenAlexaff
Pascale Reinhardt-Poulin, J. R. McLean, Yvon Deslauriers, W. Gorman, S. Cabat, Mahmoud Rouabhia

Notice bibliographique

RevuePhotochemistry and Photobiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensUniversité LavalHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXeroderma pigmentosumComet assayDNA damageDNADNA repairCometMolecular biologyChemistryBiophysicsBiologyBiochemistryAstrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The alkaline and neutral comet assays have been widely used to assess DNA damage and repair in individual cells after in vivo or in vitro exposure to chemical or physical genotoxins. Cells processed under neutral conditions generate comets primarily from DNA double strand breaks, whereas under alkaline conditions, comets arise from DNA single and double strand breaks and alkali-labile lesions. A modified version of the alkaline comet assay, as described here, used silver stain to visualize the comets and a Gelbond base to facilitate the manipulation and processing of samples. To demonstrate how these modifications improve the assay, fibroblasts derived from both normal and Xeroderma pigmentosum (Xp) individuals were exposed to simulated solar radiation and the resulting DNA damage and repair evaluated and compared with results from the relevant literature. Comets from normal fibroblasts reached their maximum length at about an hour after irradiation. Dose-dependent increases in comet length were observed up to at least 360 mJ/cm2. In contrast, comet lengths from repair deficient Xp fibroblasts were shorter than normal cells reflecting their reduced capacity to generate single strand breaks by the excision of DNA dimers. For incubation times of more than 1 h, comet lengths from normal fibroblasts underwent a time-dependent decrease, supporting the contention that this change was related to the ligation step in the DNA repair process. These changes were compatible with the model of DNA damage and repair established by others for ultraviolet radiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,710

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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