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Enregistrement W1705316507 · doi:10.1111/j.1742-4658.2007.05651.x

Observation of a chaotic multioscillatory metabolic attractor by real‐time monitoring of a yeast continuous culture

2007· article· en· W1705316507 sur OpenAlexaff
Marc R. Roussel, David Lloyd

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNonlinear Dynamics and Pattern Formation
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAttractorLyapunov exponentChaoticYeastSaccharomyces cerevisiaeCarbon dioxideInletChemistryComputationBiological systemPhysicsAnalytical Chemistry (journal)ChromatographyComputer scienceMathematicsMathematical analysisAlgorithmBiochemistryBiologyOceanography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We monitored a continuous culture of the yeast Saccharomyces cerevisiae by membrane-inlet mass spectrometry. This technique allows very rapid simultaneous measurements (one point every 12 s) of several dissolved gases. During our experiment, the culture exhibited a multioscillatory mode in which the dissolved oxygen and carbon dioxide records displayed periodicities of 13 h, 36 min and 4 min. The 36- and 4-min modes were not visible at all times, but returned at regular intervals during the 13-h cycle. The 4-min mode, which has not previously been described in continuous culture, can also be seen when the culture displays simpler oscillatory behavior. The data can be used to visualize a metabolic attractor of this system, i.e. the set of dissolved gas concentrations which are consistent with the multioscillatory state. Computation of the leading Lyapunov exponent reveals the dynamics on this attractor to be chaotic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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