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Enregistrement W1706703097 · doi:10.1046/j.1365-294x.2002.01605.x

Evaluating the effects of historic bottleneck events: an assessment of microsatellite variability in the endangered, North Atlantic right whale

2002· article· en· W1706703097 sur OpenAlexafffund
R. C. Waldick, Scott D. Kraus, Moira W. Brown, Bradley N. White

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries ServiceNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTrent UniversityWorld Wildlife Fund
Mots-clésPopulation bottleneckBiologyRight whaleMicrosatellitePopulationGenetic diversityGenetic variabilityEndangered speciesGenetic variationZoologyEffective population sizeLoss of heterozygosityAlleleEcologyEvolutionary biologyWhaleGeneticsDemographyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Commercial exploitation reduced the North Atlantic right whale (Eubalaena glacialis) population from c. 12,000 in the 11th century to around 300 by the 21st century. We examine the effect of this population decline on levels of genetic variation at 16 microsatellite loci and contrast levels of variability to that in a closely related species (E. australis). Of the 13 loci developed from the E. glacialis genome, 100% were polymorphic in E. australis. In contrast, nine loci were polymorphic in E. glacialis and four were fixed. Both allelic diversity (A) and heterozygosity (H) were significantly lower in E. glacialis than E. australis (A = 3.2 +/- 2.6 vs. A= 6.9 +/- 3.3, P < 0.001; H= 0.31 +/- 0.25 vs. H= 0.72 +/- 0.23, P < 0.001, respectively). Bottleneck anlayses indicate that the population is in mutation-drift equilibrium and that a genetic bottleneck did not occur during the most recent decline (18th-20th centuries). Nevertheless, low frequency alleles are relatively uncommon in E. glacialis, suggesting that genetic variability has been reduced in this population. Possible origins of low genetic variability are discussed, including the slow but continual erosion of alleles during the 800-year period of decline.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,836

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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