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Enregistrement W1707297352 · doi:10.1139/g05-088

Genomic instability in <i>Solanum tuberosum</i> × <i>Solanum kurtzianum</i> interspecific hybrids

2006· article· en· W1707297352 sur OpenAlexvenueno aff
Carlos Federico Marfil, Ricardo W. Masuelli, Jerry Davison, Luca Comai

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSecretaría de Ciencia y Técnica, Universidad de Buenos AiresUniversidad Nacional de Cuyo
Mots-clésBiologySolanum tuberosumHybridAmplified fragment length polymorphismSolanumPloidyInterspecific competitionInterspecific hybridsGeneticsDNA methylationGenomeBotanyGenetic diversityGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The use of interspecific crosses in breeding is an important strategy in improving the genetic base of the modern cultivated potato, Solanum tuberosum L. Until now, it has normally been interspecific Solanum hybrids that have been morphologically and cytologically characterized. However, little is known about the genomic changes that may occur in the hybrid nucleus owing to the combination of genomes of different origin. We have observed novel AFLP bands in Solanum tuberosum x Solanum kurtzianum diploid hybrids; 40 novel fragments were detected out of 138 AFLP fragments analyzed. No cytological abnormalities were observed in the hybrids; however, we found DNA methylation changes that could be the cause of the observed genomic instabilities. Of 277 MSAP fragments analyzed, 14% showed methylation patterns that differed between the parental species and the hybrids. We also observed frequent methylation changes in the BC1 progeny. Variation patterns among F1 and BC1 plants suggest that some methylation changes occurred at random. The changes observed may have implications for potato breeding as an additional source of variability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,419

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,177
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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