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Enregistrement W1710227085 · doi:10.1046/j.1471-4159.2003.02264.x

Identification of a residue in the γ‐aminobutyric acid type A receptor α subunit that differentially affects diazepam‐sensitive and ‐insensitive benzodiazepine site binding

2004· article· en· W1710227085 sur OpenAlexafffund
Jason M. C. Derry, Susan M. J. Dunn, Martin Davies

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésReceptorProtein subunitGABAA receptorChemistryBinding siteAgonistBiochemistryG alpha subunitInterleukin 10 receptor, alpha subunitStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GABAA receptors that contain either the alpha4- or alpha6-subunit isoform do not recognize classical 1,4-benzodiazepines (BZDs). However, other classes of BZD site ligands, including beta-carbolines, bind to these diazepam-insensitive receptor subtypes. Some beta-carbolines [e.g. ethyl beta-carboline-3-carboxylate (beta-CCE) and methyl 6,7-dimethoxy-4-ethyl-beta-carboline-3-carboxylate (DMCM)] display a higher affinity for alpha4- compared to alpha6-containing receptors. In order to identify the structural determinants that underlie these affinity differences, we constructed chimeric alpha6/alpha4 subunits and co-expressed these with wild-type rat beta2 and gamma2L subunits in tsA201 cells for radioligand binding analysis. After identification of candidate regions, site-directed mutagenesis was used to narrow the ligand selectivity to a single amino acid residue (alpha6N204/alpha4I203). Substitutions at alpha6N204 did not alter the affinity of the imidazobenzodiazepine Ro15-4513. A homologous mutation in the diazepam-sensitive alpha1 subunit (S205N) resulted in a 7-8-fold reduction in affinity for the beta-carbolines examined. Although the binding of the classical agonist flunitrazepam was relatively unaffected by this mutation in the alpha1 subunit, the affinity for Ro15-1788 and Ro15-4513 was decreased by approximately 19-fold and approximately 38-fold respectively. The importance of this residue, located in the Loop C region of the extracellular N-terminus of the subunit protein, emphasizes the differential interaction of ligands with the alpha subunit in diazepam-sensitive and -insensitive receptors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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