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Enregistrement W171899457 · doi:10.1155/2009/413749

Antimicrobial Susceptibility of Invasive and Lower Respiratory Tract Isolates of <i>Streptococcus pneumoniae</i>, 1998 to 2007

2009· article· en· W171899457 sur OpenAlexafffundabout
Otto G. Vanderkooi, Athena McConnell, Deirdre L. Church, James D. Kellner

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Children's Hospital FoundationChildren's Hospital Foundation
Mots-clésStreptococcus pneumoniaeMicrobiologyAntimicrobialRespiratory tract infectionsMedicineBiologyVirologyRespiratory systemAntibioticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous surveys of antimicrobial resistance in Streptococcus pneumoniae have found differences depending on source of isolate (eg, higher resistance in lower respiratory tract [LRT] versus invasive isolate) and age (higher resistance in children versus adults). Susceptibility profiles in the Calgary Health Region (approximately 1.25 million population) over a 10-year period were studied. Prospective laboratory-based population surveillance for S pneumoniae disease has been conducted since 1998. Patient demographics and susceptibility testing were analyzed. In total, 2382 patient isolates were available for analysis from 1998 to 2007. Of these, 1170 isolates were invasive while 496 were LRT. Patient age distribution was: younger than five years, 14%; five to 17 years, 6%; 18 to 64 years, 56%; and 65 years or older, 24%. Mean patient age was 44.8 years and 60.0% were male. The overall incidence of nonsusceptibility was: penicillin, 8.2%; amoxicillin, 0.3%; cefuroxime, 6.2%; ceftriaxone, 1.7%; erythromycin, 8.8%; trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX), 25.6%; clindamycin, 2.3%; and levofloxacin, 0.2%. Overall resistance rates were stable, except for increasing erythromycin resistance from 5.4% (1998) to a high of 14.2% (2004) (P=0.007). Isolates that were nonsusceptible to penicillin or TMP-SMX were more likely to be multidrug resistant (P<0.001) compared with penicillin- or TMP-SMX-susceptible isolates. Compared with invasive isolates, LRT isolates showed more resistance to penicillin, TMP-SMX, cefuroxime and erythromycin, and were more likely to be multidrug resistant. Isolates from children younger than five years of age are more likely to be multidrug resistant and resistant to erythromycin and cefotaxime. Ongoing surveillance of S pneumoniae isolates is important because resistance rates vary by source and patient age among health care regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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