Antimicrobial Susceptibility of Invasive and Lower Respiratory Tract Isolates of <i>Streptococcus pneumoniae</i>, 1998 to 2007
Notice bibliographique
Résumé
Previous surveys of antimicrobial resistance in Streptococcus pneumoniae have found differences depending on source of isolate (eg, higher resistance in lower respiratory tract [LRT] versus invasive isolate) and age (higher resistance in children versus adults). Susceptibility profiles in the Calgary Health Region (approximately 1.25 million population) over a 10-year period were studied. Prospective laboratory-based population surveillance for S pneumoniae disease has been conducted since 1998. Patient demographics and susceptibility testing were analyzed. In total, 2382 patient isolates were available for analysis from 1998 to 2007. Of these, 1170 isolates were invasive while 496 were LRT. Patient age distribution was: younger than five years, 14%; five to 17 years, 6%; 18 to 64 years, 56%; and 65 years or older, 24%. Mean patient age was 44.8 years and 60.0% were male. The overall incidence of nonsusceptibility was: penicillin, 8.2%; amoxicillin, 0.3%; cefuroxime, 6.2%; ceftriaxone, 1.7%; erythromycin, 8.8%; trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX), 25.6%; clindamycin, 2.3%; and levofloxacin, 0.2%. Overall resistance rates were stable, except for increasing erythromycin resistance from 5.4% (1998) to a high of 14.2% (2004) (P=0.007). Isolates that were nonsusceptible to penicillin or TMP-SMX were more likely to be multidrug resistant (P<0.001) compared with penicillin- or TMP-SMX-susceptible isolates. Compared with invasive isolates, LRT isolates showed more resistance to penicillin, TMP-SMX, cefuroxime and erythromycin, and were more likely to be multidrug resistant. Isolates from children younger than five years of age are more likely to be multidrug resistant and resistant to erythromycin and cefotaxime. Ongoing surveillance of S pneumoniae isolates is important because resistance rates vary by source and patient age among health care regions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».