Comparison of genetic differentiation at marker loci and quantitative traits
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The comparison of the degree of differentiation in neutral marker loci and genes coding quantitative traits with standardized and equivalent measures of genetic differentiation (FST and QST, respectively) can provide insights into two important but seldom explored questions in evolutionary genetics: (i) what is the relative importance of random genetic drift and directional natural selection as causes of population differentiation in quantitative traits, and (ii) does the degree of divergence in neutral marker loci predict the degree of divergence in genes coding quantitative traits? Examination of data from 18 independent studies of plants and animals using both standard statistical and meta-analytical methods revealed a number of interesting points. First, the degree of differentiation in quantitative traits (QST) typically exceeds that observed in neutral marker genes (FST), suggesting a prominent role for natural selection in accounting for patterns of quantitative trait differentiation among contemporary populations. Second, the FST – QST difference is more pronounced for allozyme markers and morphological traits, than for other kinds of molecular markers and life-history traits. Third, very few studies reveal situations were QST < FST, suggesting that selection pressures, and hence optimal phenotypes, in different populations of the same species are unlikely to be often similar. Fourth, there is a strong correlation between QST and FST indices across the different studies for allozyme (r=0.81), microsatellite (r=0.87) and combined (r=0.75) marker data, suggesting that the degree of genetic differentiation in neutral marker loci is closely predictive of the degree of differentiation in loci coding quantitative traits. However, these interpretations are subject to a number of assumptions about the data and methods used to derive the estimates of population differentiation in the two sets of traits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».