Calpain‐mediated degradation of reversibly oxidized protein‐tyrosine phosphatase 1B
Notice bibliographique
Résumé
Protein‐tyrosine phosphatases (PTPs) are regulated by reversible inactivating oxidation of the catalytic‐site cysteine. We have previously shown that reversible oxidation upon UVA irradiation is followed by calpain‐mediated PTP degradation. Here, we address the mechanism of regulated cleavage and the physiological function of PTP degradation. Reversible oxidation of PTP1B in vitro strongly facilitated the association with calpain and led to greatly increased calpain‐dependent inactivating cleavage. Both oxidation‐induced association and cleavage depended exclusively on the presence of the catalytic (reversibly oxidized) cysteine residue 215. A major cleavage site was identified preceding amino acid position Ala77. In calpain‐deficient cells, insulin signaling was apparently diminished, consistent with a possible role for calpain in removing a negative regulator of insulin signaling. Reversibly oxidized PTP1B may be a target of calpain in this context. Structured digital abstract MINT‐7234580 : Calpain 4 (uniprotkb: P04632 ) and Calpain 1 (uniprotkb: P07384 ) physically interact ( MI:0915 ) with PTP1B (uniprotkb: P18031 ) by enzyme linked immunosorbent assay ( MI:0411 ) MINT‐7234562 , MINT‐7234481 : Calpain 4 (uniprotkb: P04632 ) and Calpain 1 (uniprotkb: P07384 ) cleave ( MI:0194 ) PTP1B (uniprotkb: P18031 ) by protease assay ( MI:0435 )
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».