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Enregistrement W1723564271 · doi:10.1111/j.1742-4658.2009.07255.x

Calpain‐mediated degradation of reversibly oxidized protein‐tyrosine phosphatase 1B

2009· article· en· W1723564271 sur OpenAlexaff
Antje Trümpler, Bernhard Schlott, Peter Herrlich, Peter A. Greer, Frank‐D. Böhmer

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésCalpainBiochemistryCysteineChemistryCysteine proteaseTyrosineProteaseProteolysisCell biologyEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein‐tyrosine phosphatases (PTPs) are regulated by reversible inactivating oxidation of the catalytic‐site cysteine. We have previously shown that reversible oxidation upon UVA irradiation is followed by calpain‐mediated PTP degradation. Here, we address the mechanism of regulated cleavage and the physiological function of PTP degradation. Reversible oxidation of PTP1B in vitro strongly facilitated the association with calpain and led to greatly increased calpain‐dependent inactivating cleavage. Both oxidation‐induced association and cleavage depended exclusively on the presence of the catalytic (reversibly oxidized) cysteine residue 215. A major cleavage site was identified preceding amino acid position Ala77. In calpain‐deficient cells, insulin signaling was apparently diminished, consistent with a possible role for calpain in removing a negative regulator of insulin signaling. Reversibly oxidized PTP1B may be a target of calpain in this context. Structured digital abstract MINT‐7234580 : Calpain 4 (uniprotkb: P04632 ) and Calpain 1 (uniprotkb: P07384 ) physically interact ( MI:0915 ) with PTP1B (uniprotkb: P18031 ) by enzyme linked immunosorbent assay ( MI:0411 ) MINT‐7234562 , MINT‐7234481 : Calpain 4 (uniprotkb: P04632 ) and Calpain 1 (uniprotkb: P07384 ) cleave ( MI:0194 ) PTP1B (uniprotkb: P18031 ) by protease assay ( MI:0435 )

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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