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Enregistrement W1724231811 · doi:10.1002/bab.1166

Cloning and <i>in vitro</i> function analysis of codon‐optimized <i>FatI</i> gene

2013· article· en· W1724231811 sur OpenAlexaff
Xiao‐Feng Sun, Xing‐Hong Sun, Mei‐Li Teng, Huanqi Liu, Lingjiang Min, Qingjie Pan, Guo‐Qing Qin, Wei Shen, Li Lan

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Applied Biochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensResearch Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolyunsaturated fatty acidBiologyCodon usage biasGeneMolecular biologyTransfectionCoding regionFatty acid desaturaseBiochemistryGenomeGeneticsFatty acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Currently, n-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFAs) have attracted great attention because of their biological significance to organisms. In addition, PUFAs show an obvious impact on prevention and treatment of various diseases. Because n-3 PUFAs cannot be endogenously synthesized by mammals, mammals have to rely on a dietary supplement for sufficient supply. The finding and application of the fatty acid dehydrogenase I (FatI) gene are expected to change the current situation because it can convert n-6 polyunsaturated fatty acids (n-6 PUFAs) to n-3 PUFAs. Meanwhile, the gradual maturation of transgenic technology makes it possible to produce transgenic animals that can synthesize n-3 PUFAs by themselves. In this study, the DNA coding sequence of FatI was synthesized by a chemical method after codon optimization according to the mammal's codon bias. The synthesized DNA sequence was introduced into Boer goat fetal fibroblasts by the constructed recombinant eukaryotic expression vector pcDNA3.1(+)-FatI. Boer goat fetal fibroblasts were transfected by electroporation, and the stable transfected cell lines were obtained by G418 selection. Genomic DNA PCR and Southern blot were applied to verify that the foreign gene FatI was integrated into the genome of the Boer goat fibroblasts. RT-PCR results showed the expression of FatI gene at the mRNA level. The fatty acid profile of cells carrying the FatI gene revealed an increase in total n-3 PUFAs (from 0.61 to 0.95), but a decrease in n-6 PUFAs (from 10.34 to 9.85), resulting in a remarkable increase in the n-3:n-6 ratio (from 0.059 to 0.096). The n-3:n-6 ratio had a 63.49 percent increase, which is a precursor of the response of n-3 desaturase activity of the FatI gene. The study may provide a practical tool for producing transgenic animals that can produce n-3 PUFAs by themselves, and we hope that the application will lay the foundation for animals producing n-3 PUFAs, which will benefit human nutrition and wellness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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