Monitoring PfMDR1 transport in Plasmodium falciparum
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Plasmodium falciparum multidrug resistance 1 transporter, PfMDR1, contains five amino acid polymorphisms that are suggested to be involved in altered drug transport from the parasite's cytosol into the digestive vacuole (DV). Transport of a substrate into another intracellular compartment influences drug availability at its site of action, therefore making the parasite more susceptible or resistant to a drug. Fluo-4 is a known fluorescent substrate that can be used as a molecular tool to investigate transport dynamics of PfMDR1 in many parasite strains. METHODS: Six P. falciparum strains with varying PfMDR1 mutations were loaded with Fluo-4 AM. Accumulation of the fluorophore in the DV was measured using confocal microscopy. The role of a key amino acid mutation was verified using selected parasite clones with point mutations at PfMDR1 amino acid position 1042. Equal expression of PfMDR1 was confirmed by Western blot. RESULTS: Fluo-4 was transported by PfMDR1 into the DV of most drug-sensitive and -resistant parasites. Asparagine at PfMDR1 amino acid position 1042 was crucial for Fluo-4 transport, while the N1042D substitution abolished Fluo-4 transport. Competition studies of Fluo-4 with chloroquine, quinine and mefloquine were performed on parasites harbouring asparagine at position 1042. A distinct Fluo-4 transport inhibition pattern for each tested anti-malarial drug was observed in parasite strains of different genetic background. CONCLUSION: This study demonstrates that Fluo-4 can be used to investigate PfMDR1 transport dynamics in both drug-sensitive and -resistant parasites. Furthermore, direct evidence of altered Fluo-4 transport in PfMDR1 is linked to a single amino acid mutation in the substrate binding pocket. This system offers a great tool to investigate the role of substrate transport by PfMDR1 and the mutations necessary to support transport, which would lead to new insights for the development of novel anti-malarial drugs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».