MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1729198678 · doi:10.1186/s12936-015-0791-3

Monitoring PfMDR1 transport in Plasmodium falciparum

2015· article· en· W1729198678 sur OpenAlexafffund
Sarah J. Reiling, Petra Rohrbach

Notice bibliographique

RevueMalaria Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutscher Akademischer Austauschdienst
Mots-clésPlasmodium falciparumParasitologyMalariaVirologyTropical medicineBiologyPublic healthMedicineImmunologyPathologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Plasmodium falciparum multidrug resistance 1 transporter, PfMDR1, contains five amino acid polymorphisms that are suggested to be involved in altered drug transport from the parasite's cytosol into the digestive vacuole (DV). Transport of a substrate into another intracellular compartment influences drug availability at its site of action, therefore making the parasite more susceptible or resistant to a drug. Fluo-4 is a known fluorescent substrate that can be used as a molecular tool to investigate transport dynamics of PfMDR1 in many parasite strains. METHODS: Six P. falciparum strains with varying PfMDR1 mutations were loaded with Fluo-4 AM. Accumulation of the fluorophore in the DV was measured using confocal microscopy. The role of a key amino acid mutation was verified using selected parasite clones with point mutations at PfMDR1 amino acid position 1042. Equal expression of PfMDR1 was confirmed by Western blot. RESULTS: Fluo-4 was transported by PfMDR1 into the DV of most drug-sensitive and -resistant parasites. Asparagine at PfMDR1 amino acid position 1042 was crucial for Fluo-4 transport, while the N1042D substitution abolished Fluo-4 transport. Competition studies of Fluo-4 with chloroquine, quinine and mefloquine were performed on parasites harbouring asparagine at position 1042. A distinct Fluo-4 transport inhibition pattern for each tested anti-malarial drug was observed in parasite strains of different genetic background. CONCLUSION: This study demonstrates that Fluo-4 can be used to investigate PfMDR1 transport dynamics in both drug-sensitive and -resistant parasites. Furthermore, direct evidence of altered Fluo-4 transport in PfMDR1 is linked to a single amino acid mutation in the substrate binding pocket. This system offers a great tool to investigate the role of substrate transport by PfMDR1 and the mutations necessary to support transport, which would lead to new insights for the development of novel anti-malarial drugs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,499

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMalaria JournalMême sujetDrug Transport and Resistance MechanismsTravaux en français237 207