Validation of molecular markers for marker-assisted pyramiding of white rust resistance loci in Indian Mustard (<i>Brassica juncea</i> L.)
Notice bibliographique
Résumé
Singh, B. K., Nandan, D., Supriya, A., Ram, B., Kumar, A., Singh, T., Meena, H. S., Kumar, V., Singh, V. V., Rai, P. K. and Singh, D. 2015. Validation of molecular markers for marker-assisted pyramiding of white rust resistance loci in Indian Mustard (Brassica juncea L.). Can. J. Plant Sci. 95: 939–945. Successful application of molecular markers in marker-assisted pyramiding relies on effective determination of the target phenotype. In this respect, evaluation of the efficiency of markers for marker-assisted selection through cross-validation in different genetic backgrounds and in different populations is a crucial step. In the present study, the previously identified Arabidopsis-derived intron polymorphic (IP) markers At5g41560 and At2g36360, which were highly linked with AcB1-A4.1 and AcB1-A5.1, respectively, were validated in a set of 25 genotypes of Indian Mustard and in three different F 2 populations. The relationships between the variation of PCR products of the two markers with the percent disease index (PDI) of the tested genotypes, and the co-segregation analysis of the markers with disease phenotype in F 2 populations clearly indicated that At5g41560 and At2g36360 are genotype-nonspecific markers and are closely linked to white rust resistance loci AcB1-A4.1 and AcB1-A5.1, respectively. It also became evident from the present study that AcB1-A4.1 and an another white rust resistance locus Ac(2)t are likely the same gene locus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».