Identification of transcription factors involved in the transcriptional regulation of the CXCL12 gene in rat pancreatic insulinoma Rin-5F cell line
Notice bibliographique
Résumé
Diabetes is characterized by a deficit in the number of functional pancreatic β-cells. Understanding the mechanisms that stimulate neogenesis of β-cells should contribute to improved maintenance of β-cell mass. Chemokine CXCL12 has recently become established as a novel β-cell growth factor, however the mechanisms controlling its expression require clarification. We investigated the proteins involved in the transcriptional regulation of the rat β-cell CXCL12 gene (Cxcl12). Using the electrophoretic mobility shift assay and chromatin immunoprecipitation, we established the in vitro and in vivo binding of C/EBPβ, C/EBPα, STAT3, p53, FOXO3a, and HMG I/Y to the Cxcl12 promoter. Co-immunoprecipitation experiments revealed protein-protein interactions between YY1 and PARP-1, FOXO3a and PARP-1, Sp1 and PARP-1, p53 and PARP-1, C/EBPβ and PARP-1, YY1 and p53, YY1 and FOXO3a, p53 and FOXO3a, Sp1 and FOXO3a, C/EBPβ and FOXO3a, C/EBPα and FOXO3a, Sp1 and STAT3. Our data lay the foundation for research into the interplay of signaling pathways that determine the β-cell Cxcl12 expression profile.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».