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Enregistrement W1734173180 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-1553

Abstract 1553: Rho guanine nucleotide exchange factor (ARHGEF) 10 is a putative tumor suppressor in pancreatic ductal adenocarcinoma

2014· article· en· W1734173180 sur OpenAlexaff
Joella Joseph, Nikolina Radulovich, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchBiologyCancerCell cultureTumor suppressor genePancreatic cancerGuanine nucleotide exchange factorCell growthTumor progressionAdenocarcinomaSignal transductionCarcinogenesisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) accounts for over 90% of pancreatic malignancies, and is the fourth leading cause of cancer related deaths. Disease prognosis is quite poor, with less than 20% of patients eligible for curative surgical resection at time of diagnosis and overall survival rates of 2%. PDAC arises from the malignant transformation of ductal epithelial cells through progressive accumulation of loss of function mutations and deletions of tumor suppressor genes. Chromosome 8p has been shown to be a recurrent site of deletions in PDAC. Among the deleted genes is the Rho guanine nucleotide exchange factor 10 (ARHGEF10), a regulator of Rho signaling that is involved in mitotic spindle formation. Here, we evaluate ARHGEF10 for its potential role as a tumor suppressor in PDAC. Methods: ARHGEF10 expression was assessed in 19 PDAC cell lines and in 53 patient tumor xenograft samples at both mRNA and protein levels. Publically available datasets were also used to determine correlation between ARHGEF10 mRNA expression and DNA copy number. After identifying PDAC cell lines with low ARHGEF10 expression, ARGHEF10 was stably overexpressed in these cell lines by lentiviral transduction. The effects of ARHGEF10 expression were then evaluated by in vivo tumorigenicity in immunodeficient mice, and by in vitro cell proliferation and cell motility wound healing assays. Results: ARHGEF10 showed reduced expression in up to 70% of cell lines and patient tumor xenografts. Reduced ARHGEF10 expression correlated significantly with loss of copy number in PDAC cell lines. Stable overexpression of ARHGEF10 in PDAC cell lines significantly reduced tumor growth in immunodeficient mice. In addition, ARHGEF10 expression resulted in decreased cell motility in wound healing assays, but had minimal effect on cell proliferation. Experiments for in vitro assessment of invasion and changes in Rho activity are ongoing, and will be presented Conclusions: This study suggests that ARHGEF10 may function as a tumor suppressor gene in PDAC. Citation Format: Joella Joseph, Nikolina Radulovich, Ming-Sound Tsao. Rho guanine nucleotide exchange factor (ARHGEF) 10 is a putative tumor suppressor in pancreatic ductal adenocarcinoma. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 1553. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-1553

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
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