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Enregistrement W1743609051 · doi:10.1016/s1567-1356(03)00113-2

The D1/D2 domain of the large-subunit rDNA of the yeast species is unusually polymorphic

2003· article· en· W1743609051 sur OpenAlexafffund
Marc‐André Lachance, Heide-Marie Daniel, Wieland Meyer, G. S. Prasad, Shiva Gautam, Kyria Boundy‐Mills

Notice bibliographique

RevueFEMS Yeast Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyYeastProtein subunitGeneticsRibosomal RNADomain (mathematical analysis)Evolutionary biologyComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ten different versions of the D1/D2 divergent domain of the large-subunit ribosomal DNA were identified among interbreeding members of the yeast species Clavispora lusitaniae. One major polymorphism, located in a 90-bp structural motif of the D2 domain, exists in two versions that differ by 32 base substitutions. Three other polymorphisms consist of a two-base substitution, a two-base deletion, and a single-base deletion, respectively. The polymorphisms are independent of one another and of the two mating types, indicating that the strains studied belong to a single, sexually active Mendelian population. Several strains were heterogeneous for one or more of the polymorphisms, and one strain was found to be automictic and capable of producing asci on its own by isogamous conjugation or by bud-parent autogamy. These observations suggest circumspection in the use of sequence divergence as the principal criterion for delimiting yeast species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations128
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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