A new brain‐derived neurotrophic factor transcript and decrease inbrain‐derived neurotrophic factor transcripts 1, 2 and 3 in Alzheimer's disease parietal cortex
Notice bibliographique
Résumé
Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) supports hippocampal, cortical and basal forebrain cholinergic neurons, which lose function in Alzheimer's disease. In Alzheimer's tissues such as hippocampus and parietal cortex, brain- derived neurotrophic factor mRNA is decreased three- to four-fold compared with controls. However, the molecular mechanism of the down-regulation of BDNF in Alzheimer's disease is unknown. The human brain-derived neurotrophic factor gene has multiple promoters governing six non-coding upstream exons that are spliced to one downstream coding exon, leading to six different transcripts. Here we report an alternate human splice variant within exon 4I for a total of seven transcripts. Previous brain-derived neurotrophic factor mRNA measurements in Alzheimer's disease tissue were done using the downstream coding exon present in all transcripts. Using RT-PCR primers specific for each upstream exon, we observe a significant decrease in three human brain-derived neurotrophic factor mRNA transcripts in Alzheimer's disease samples compared with controls. Transcripts 1 and 3 each exhibit a two-fold decrease, and transcript 2 shows a five-fold decrease. There are no significant differences between control and Alzheimer's disease samples for the other transcripts, including the new splice variant. In rat, both transcripts 1 and 3 are regulated through the transcription factor cAMP response element binding protein, whose phosphorylation is decreased in the Alzheimer's disease brain. This could lead to specific down-regulation of the brain-derived neurotrophic factor transcripts shown here.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».