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Enregistrement W1748977491 · doi:10.1002/jor.22641

Gene expression profiles reveal that chondrogenic progenitor cells and synovial cells are closely related

2014· article· en· W1748977491 sur OpenAlexfundno aff
Cheng Zhou, Hongjun Zheng, Dongrim Seol, Yin Yu, James A. Martin

Notice bibliographique

RevueJournal of Orthopaedic Research® · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesArthritis SocietyU.S. Department of Defense
Mots-clésChondrogenesisChemokineCell biologyCartilageChemistryProgenitor cellMolecular biologyBiologyImmunologyImmune systemStem cellAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We showed previously that chondrogenic progenitor cells (CPCs) from the superficial zone of articular cartilage respond vigorously to cartilage wounding by responding chemotactically to cell debris, but the physiologic functions of CPCs remain unclear. To help bridge this knowledge gap we undertook a comparative analysis of gene expression in bovine CPCs, chondrocytes, synovial fibroblasts (synoviocytes), and cells isolated from synovial fluid (SFCs). Analysis of microarrays parsed the four cell types into two distinct groups, one composed only of chondrocytes and the other of CPCs, synoviocytes, and SFCs. The groups differed with respect to metalloendopeptidase, collagen, and cytokine gene expression. Quantitative PCR showed that, relative to chondrocytes, all other cells under-expressed cartilage matrix genes. CPCs significantly over-expressed genes encoding the chemokines interleukin 8 (IL8), and C-C motif ligand 2, while synoviocytes over-expressed the chemokine C-X-C motif Ligand 12. Sulfated glycosaminoglycan deposition in pellet cultures by CPCs was intermediate between chondrocytes and synoviocytes/SFCs. These results indicate that the CPC phenotype more closely resembles synoviocytes and SFCs than chondrocytes. CPCs show a tendency to over-express chemokines that promote immune cell chemotaxis, suggesting they mediate inflammation in response to cartilage wounding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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