Gene expression profiles reveal that chondrogenic progenitor cells and synovial cells are closely related
Notice bibliographique
Résumé
We showed previously that chondrogenic progenitor cells (CPCs) from the superficial zone of articular cartilage respond vigorously to cartilage wounding by responding chemotactically to cell debris, but the physiologic functions of CPCs remain unclear. To help bridge this knowledge gap we undertook a comparative analysis of gene expression in bovine CPCs, chondrocytes, synovial fibroblasts (synoviocytes), and cells isolated from synovial fluid (SFCs). Analysis of microarrays parsed the four cell types into two distinct groups, one composed only of chondrocytes and the other of CPCs, synoviocytes, and SFCs. The groups differed with respect to metalloendopeptidase, collagen, and cytokine gene expression. Quantitative PCR showed that, relative to chondrocytes, all other cells under-expressed cartilage matrix genes. CPCs significantly over-expressed genes encoding the chemokines interleukin 8 (IL8), and C-C motif ligand 2, while synoviocytes over-expressed the chemokine C-X-C motif Ligand 12. Sulfated glycosaminoglycan deposition in pellet cultures by CPCs was intermediate between chondrocytes and synoviocytes/SFCs. These results indicate that the CPC phenotype more closely resembles synoviocytes and SFCs than chondrocytes. CPCs show a tendency to over-express chemokines that promote immune cell chemotaxis, suggesting they mediate inflammation in response to cartilage wounding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».